肛周囊肿是可以保守治疗的。肛周脓肿的保守治疗方法，是在肛周脓肿早期，肛周触及到硬结还没有化脓，此时应该积极的抗感染治疗，可以口服治疗。同时每次排便后要用花椒水熏蒸坐浴，每天两次。同时要禁食辛辣生冷，刺激油腻的食物。
治疗的方法就是口服药物和手术的方法治疗，口服药物，无效时一定要通过手术的方法治疗，当前医学水平还没有治疗囊肿的特效方法。对于小的囊肿，无症状时不需要做任何治疗，但要定期复查，观察囊肿是否继续增大。严重的囊肿可考虑手术。
肛周脓肿应及早就医。手术治疗是手术治疗的最主要的方法，主要采用抽脓减压、切开排脓的治疗方法，根据不同位置的肛周脓肿，采用不同的手术方式：低位脓肿－直接切开；马蹄脓肿－切开加旷置；高位脓肿－挂线术；高位脓肿-等压引流术。
肛瘘不可以保守治疗，肛瘘需要手术治疗，可以去正规医院做手术。平时要注意个人卫生，每天要用温水清洗肛门。注意饮食，多喝水，多吃蔬菜水果，少吃油腻辛辣的食物，不要抽烟喝酒，不要熬夜，作息规律保证充足的睡眠。
肛周脓肿的保守治疗主要包括以下几个方面抗生素抗感染治疗，在临床上一般选用对革兰阴性杆菌有效的抗生素进行抗感染治疗，做过肛周脓肿脓液的细菌培养加药敏试验，要根据细菌培养加药敏试验的结果。
