小儿在腹泻时多少都伴有肠道菌群的紊乱，可服用一些肠道微生态制剂，或肠黏膜保护剂。肠道微生态制剂和肠黏膜保护剂可以帮助缩短腹泻病程，效果良好。婴儿腹泻治疗方法具体还要看孩子的病情。病症重则需要去医院就医。
宝宝拉肚子时不建议吃东西，哺乳后可以继续哺乳，但要吃清淡的食物。六个月以内婴幼儿配方奶喂养，6个月后可以继续吃粥、面条、烂饭等清淡食物。进食量减少的情况下可以多喂孩子，尽量不要让孩子多吃含粗纤维的蔬菜、水果，也不要吃高糖、生冷的食物。在腹泻的时候，要注意给孩子补充营养，要注意逐渐增加营养，由稀到稠，由少到多，让孩子的肠道有一个适应的过程。
胃不好，吃东西进去引起的慢性肠炎给孩子吃，可以吃药治疗拉肚子，调理孩子的肠道，有利于消化吸收。不吃冷的东西和油腻的食物，饮食上，注意清淡易消化，和营养的东西，注意休息。
腹泻的婴儿需要服用药物和消化粉治疗，服用补液盐以避免脱水。如有必要，可以服用一些止泻药治疗，多喝水，多吃流质食品，饮食正常，增加综合营养，必要时可以做大便。进行常规检查和血液常规检查，以确定是否存在细菌或病毒感染。
新生儿如果出现腹胀，同时又拉肚子，家长朋友直接带着宝宝到医院找专科的医生进行治疗。因为在宝宝出现腹胀的情况下，如果同时合并腹泻，我们可能考虑这个宝宝存在肠炎。对于新生儿来说，他的肠道非常薄且娇嫩，如果出现肠炎，病情进展较快，有时过久的观察或者在家里治疗起不到作用，反而会耽误宝宝的治疗。