术后会感觉到肛周疼痛。因为肛周皮肤是齿状线下方，属于体神经支配的区域，对疼痛刺激敏感，通常是可以忍受的。可以选择应用温盐水坐浴的办法，能够缓解疼痛，手术以后也应该积极进行静脉抗感染治疗。
肛瘘手术后不久(一般是术后1~3个月内)发生假性愈合的情况是指瘘外口和瘘管表面的皮肤看上去已经愈合了，但里面的瘘管并没有愈合而且还和瘘内口相通联，这就还会在瘘管内形成脓肿，最终导致肛瘘复发。
肛瘘术后伤口的换药和护理尤为重要。只有伤口恢复良好，才能被视为肛瘘手术的成功。首先需要碘伏消毒，将痔疮软膏涂在肛门塞痔栓外面。此时不要选择坐着，一定要打开伤口让分泌物排出。伤口开始寻找新鲜肉芽后，可以将毛巾放在伤口的方向，每天坐半小时。
肛瘘做完手术后只要合理护理，积极配合治疗大多数时候是不会复发的。另外术后的护理也要注意，尽量卧床休息，减少外出。不能吃辛辣刺激和油腻油炸的食物，要多吃清淡的食物。
术后第二天就可以排便了。手术后肛门坠胀，便意不尽感明显而频频蹲厕，蹲厕时间过长易导致肛门水肿或创口出血，可根据平常排便量与手术后排便量来判断大便是否一次排净。
术后第二天就可以排便了。手术后肛门坠胀，便意不尽感明显而频频蹲厕，蹲厕时间过长易导致肛门水肿或创口出血，可根据平常排便量与手术后排便量来判断大便是否一次排净。
