皮下真菌病和全身性真菌病统称为深层真菌病。我国深部真菌病的发生率急剧上升，这与广谱抗生素、类固醇、免疫抑制剂、器官移植、导管手术、糖尿病、爱滋病等因素有关。可通过如下方式治疗：
1.临床上以念珠菌、隐球菌、曲霉菌等最多，治疗深部真菌性疾病首先要消除各种诱发因素；
2.其次要根据患者的具体情况选择不同的抗菌药物：两性霉素B是目前常用的治疗药物。
3.氟胞嘧啶、制霉菌素；咪康唑、酮康唑、克霉唑、氟康唑、伊曲康唑等药物都可用于治疗该疾病。
真菌感染的原因最常见的是机体免疫力下降。浅部真菌病发生的原因通常是适宜的真菌生长条件所致。真菌感染的部位不同，症状也就不同。一般比较容易感染的部位是手和脚，很容易出现手癣和足癣的现象。会有瘙痒的感觉，当抓破了之后还有液体流出。
真菌感染不会自愈，不及时治疗可能导致病情加重，必须使用抗真菌药物治疗，可以到皮肤科检查治疗。受真菌感染时就算再痒也不能用手去抓，因为手上细菌很多抓破了会加重感染。
真菌感染可以看感染科和皮肤性病科。
真菌感染是一种常见的真菌感染，需要及时就医，常见的真菌感染有念珠菌、新隐球菌、曲霉菌等病菌的感染。如果真菌感染发生在毛发、皮肤、指甲等表面较浅的部位，可以前往皮肤性病科进行检查。如果真菌感染影响到口腔、消化道、内脏等器官，并在血液中扩散，扩散到整个身体，应前往感染科就诊。
真菌感染一般不能自愈。
皮肤霉菌感染通常不会自行治愈，要有针对性的应用一些抗菌药物。浅表皮肤的霉菌性炎症，可以用药治疗，比如：浅表皮肤的霉菌，比如：体癣，花斑癣，足癣，股癣等，可以口服联苯苄唑乳膏，特比萘芬乳膏，萘替芬酮康唑乳膏，阿莫罗芬乳膏等，这些都可以通过一定的剂量进行治疗。
