胚胎发育不好大部分会出现自然流产，一小部分胚胎存活下来，出现畸形胎儿。胚胎发育不好的原因主要是胚胎自身的异常，如出现染色体异常。还有一部分原因来自母体因素，如母体有内分泌异常，甲状腺功能低下或亢进，有高泌乳素血症时会出现胚胎发育不良。
怀孕以后出现的自然流产一般属于胚胎发育不好的情况，是人类进化自然过程适者生存的表现。自然流产后，阴道出血的时间一般不会超过10天，但是流血量会比正常来一次月经量要多。如果B超检查宫内干净，可不必处理。等下一次来月经之后，可以选择同房。但是同房期间需要采取避孕措施。自然流产以后，不要在第二个月就怀孕，最好是自然流产半年以后才准备怀疑，对女性身体都比较好。
自然流产对身体伤害大，要就减少了流产的机会。现在流产的原因是孕酮低导致的，那么在下次妊娠前要注意做一下性激素的检查，了解雌孕激素水平是否正常，好对症的调理一段时间。
自然流产半年后可以再次备孕要孩子，再次备孕前一定要检查一下导致自然流产发生的原因，如内分泌紊乱，或者有免疫方面的问题，再有溶血方面的问题，也有染色体方面的问题，或者宫腔有问题都会导致自然流产的发生。
自然流产后半年再怀孕比较好，自然流产与人工流产其实性质是一样的，都需要再次刮宫，子宫内膜也会受到不同程度的损伤，流产后需要有一个很长的恢复过程，如果子宫内膜还没有彻底的恢复，受精卵也不容易着床，有可能会再次发生自然流产。
不一定都会自然流产，虽然大部分自然流产可能会伴随着胚胎停育，会完全排除胚胎组织和附属组织，但是不排除一种现象就是不能自已流干净，导致组织稽留在宫内的现象。这个时候，流产不彻底，宫内还有残留，就要及时清宫。
