百日咳需要及时住院治疗，按呼吸道传染病隔离。为保持呼吸道通畅和利于分泌物的排出，痰多时要吸痰，患儿痉咳时注意低头体位，拍背。为防止婴儿突然窒息，夜间易发生，应有专人守护，一旦窒息及时处理，人工呼吸，吸痰，给氧。有呼吸暂停或抽搐，进行气管插管和呼吸道持续正压给氧治疗。口服药物可解除痉挛症状。
通常对症治疗。按呼吸道隔离。保持空气清新，注意营养及良好护理。避免刺激、哭泣而诱发痉咳。在药物上可以选择敏感抗生素治疗。控制感染可以服用一些消炎药来控制，另外不能吃辛辣刺激性食物和生冷食物。需要多喝白开水。如果情况依然没有减轻需要及时去医院进行下一步治疗。
婴儿患上了百日咳需要按呼吸道隔离，保持空气新鲜，避免一切可诱发痉咳的因素。加强护理以预防并发症，注意营养。幼婴儿窒息时应即刻行人工呼吸，给氧，必要时给予止痉排痰。
百日咳出血应该要增强儿童抵抗力、免疫力。儿童接触百日咳杆菌，则会导致咳嗽、祛痰、痉挛性咳嗽，并可能出现发热现象，这可以通过肺部ct，也可以通过细菌培养试验确诊，如果试验证实，一般可以选择使用抗生素这类药物至少半个月，并使用药物帮助止咳化痰。
首先要明确病原体，是单纯百日咳杆菌引起的，还是合并细菌或者病毒感染。在应用治疗的基础上，保持呼吸道通畅，解除气道痉挛，减轻肺水肿。咳嗽发作频繁，患儿出现烦躁哭闹，可以应用镇静药。
