疼痛期主要表现为牙痛，咽痛和口腔溃疡。
水泡期口腔黏膜的任何区域均可出现簇状小水泡，仿佛针头那么大，尤其在乳磨牙龈缘附近更甚，泡壁通透，粉碎后形成浅表溃疡。溃破后有少量脓性分泌物流出，疼痛难忍。糜烂期时水泡少，而汇集成簇、溃破后则可造成大范围糜烂。恢复期，在口腔溃疡和粘膜充血水肿消退后，复盖一层淡红色或白色假膜。愈合期全程需7~10天，糜烂面渐渐萎缩痊愈。
如果是单纯的疱疹性口腔炎，需要及时进行有效的处理，一星期后即可完全康复。
采用一种抗病毒疗法，疱疹性龈口炎是由于单纯疱疹病毒所致的口腔病变，粘膜会产生大量的充血水肿，形成大量的小水泡。如果是破溃的患者，出现了细菌感染，会导致伤口的恢复速度延长，所以要养成良好的生活习惯和饮食习惯，避免食用一些易引起上火的食物。
一般不会自愈，看疱疹性口腔炎是因为疱疹病毒引起的病症，可以口服一些抗病毒的药物，平时要注意多喝一些水，在烧的比较高的情况下可以服用美林，如果一直不退烧，则可以美林和泰诺林交换使用，时间间隔三到四个小时以上。
要经常保持新生儿的口腔卫生，多饮水、禁用刺激性药物，预防口腔炎症，不要让小孩吃一些辣的东西在口腔疱疹期间，要停服牛奶、少吃高蛋白一类的食物，多吃青菜、水果等清热的食物，严格执行消毒隔离制度。
疱疹性口腔炎可能会传染。
疱疹性咽峡炎、疱疹性口腔炎、手足口病都是由病毒感染引起的，病毒一般以肠道病毒为主，临床上很难鉴别，需要通过病毒抗体进行鉴别。这种病毒感染引起的疾病具有传染性，需要进行抗病毒治疗和对症治疗。注意口腔卫生，饮食清淡，多喝水，一般一周左右即可痊愈。如果持续高热或者精神状态不佳，建议患者及时就医。
疱疹性口腔炎多见于婴儿或儿童，患儿有躁动不安，发热，头痛，咽痛，啼哭拒食等症状，2～3日后体温逐渐下降，可在口腔粘膜任何部位出现病损，如唇，颊，舌以及角化良好的硬腭，牙龈和舌背，初起粘膜充血，发红，水肿，并出现数目较多成簇的。
