自然流产没流干净首先要检查B超，根据胚胎组织残留的大小，判断吃药还是手术治疗，具体情况如下：
若直径小于20mm的胚胎组织，可以益母草、五加生化胶囊等活血化瘀的药物，帮助排出胚胎组织。服药1周左右，判断药物治疗效果要去医院复查B超。服药期间适当活动，帮助排出组织物。同时，不吃生冷、辛辣、刺激的食物，可以吃一些蔬菜、水果等。若B超显示组织物直径超过20mm，且数量较多，通常吃药治疗效果不大，建议进行清宫手术。
自然流产后一般流干净了，具体分析如下：
自然流产可以排出体外，但也有一些身体素质比较弱的女性，会出现不洁的情况。如果是自然流产，一般在自然流产一周后到医院做详细的检查，如果还没有完全排出，一定要在医生的指导下进行清宫，避免感染，影响身体健康。如果已经排出了，日常生活中要注意清洁卫生，做好避孕措施，多吃一些有营养的食物，不要食用辛辣刺激性的食物，同时要把内裤和毛巾暴露在阳光下，消毒。
宫腔内的稍高回声，有可能是子宫内膜息肉，如果想确定，可以考虑宫腔镜或者直接刮宫，然后送病理检查。卵巢部位的液性暗区，可能是卵巢囊肿或者大的卵泡，可以继续观察，在月经刚干净的时候复查。
自然流产通常阴道出血的时间不超过一周，如果在自然流产后一周没有阴道出血的症状。流产后随着子宫内膜的修复，子宫的收缩，如果出血逐渐停止，那么应该就是流产干净了。
自然流产的怀孕时间不会很长，发生自然流产后的处理，可以跟药物流产的处理一样。就是发生自然流产后就口服消炎药物三到五天，同时口服活血化淤的药物，促进宫腔内的出血，排出可能的宫腔残留。一周左右做超声检查看一下有没有残留。
自然流产一般阴道出血的时间不超过一周，如果在自然流产后一周没有阴道出血的症状，说明流干净了。一般在自然流产后一周需要到医院做一个子宫附件B超或彩超检查，看看宫腔内是否有残留物的回声，如果宫腔内没有残留物的回声，说明是流干净了。
