通常来说，先天性黄疸是通过药物治疗的。
体内胆固醇水平明显偏高会导致新生儿出现黄疸，新生儿出现黄疸一般使用益生菌、茵栀黄口服液等药物进行治疗。益生菌可以有效调节儿童的肠道菌群，茵栀黄口服液可以有效的减少胆红素的肝肠循环。药物治疗可以很好地降低新生儿的先天性黄疸水平。如果先天性黄疸使用药物治疗无效，可能还要考虑手术治疗。
通常情况下，先天性胎儿有心室间隔缺损，一般会在一年之内自动关闭。具体内容如下：
但是如不能自己封闭，或是单纯的二孔导致先天性心脏缺损，应做外科治疗，4~5岁是最好的选择。尽早进行外科治疗，可以避免肺部的循环阻力增高，避免右心功能衰竭。此外，宝宝还需要进行一次心脏的超声检测。如果没有明显的扩大，或者低于6mm，可以不做手术。患儿要饮食清淡，多食新鲜蔬菜、水果，补充维生素，提高身体免疫力。营造舒适、安静的休息环境，定期通风，保持室内空气新鲜，避免上呼吸道感染。
先天性脊柱畸形可以通过坐姿、佩戴矫形支具、外科矫形改善，建议患者积极治疗，具体分析如下：
先天性脊柱畸形有两种类型，一种是姿势性的，另一种是结构性的。坐姿、佩戴矫形支具、定期复查可以改善姿势性先天性脊柱畸形，如果在这个过程中畸形加重或矫形不满意，可以进行外科矫形。结构性先天性脊柱畸形指的是先天性椎体发育不良，比如楔形椎、半椎体，或者是未知的脊柱畸形，不能用支架来矫正，需通过手术治疗。
先天性幽门狭窄可通过以下几种途径进行治疗：
第1种，手术治疗。手术切除对先天性幽门狭窄的疗效最好，应用也最为广泛。可进行幽门肌切开术。又因为先天性幽门狭窄属先天性消化道畸形。用药达不到疗效。
第2种，可通过日常饮食调节的方法治疗。但因此种疗法治疗过程较长，且疗效不如手术治疗好，故不是优先选择的方法。
一般情况下，先天性软骨病需在医生的指导下使用治疗，具体分析如下：
先天软骨病的处理：一旦诊断出先天软骨病，一定要控制好自己的活动范围，不要做太大的动作，要多注意多休息。如果是局部疼痛，可以服用氨酚待因片、洛索洛芬钠片、双氯芬酸钠缓释片、布洛芬缓释胶囊等。如果出现了软骨碎片并在关节中出现了大量的游离体块，应立即进行关节镜手术切除。这种疾病一般到了成人以后就会慢慢消退，但是会留下一个关节的变形，到了晚期就会出现骨关节炎。
先天性龟头敏感可以使用药物等办法治疗，具体分析如下：
药物或者是物理的方式可以减少龟头的敏感度，这样可以延长性生活的时间，提高性生活质量。可以用冷热水交替刺激龟头，减少龟头的敏感度。还可以用柔软的毛巾刺激龟头，减少龟头的敏感性。药物治疗是在性生活之前的半个小时内涂抹丁卡因软膏，可以起到麻醉和减少龟头的敏感度。
