宝宝半夜发烧39度应该及时遵医嘱使用口服布洛芬混悬液来治疗，要遵医嘱。
布洛芬混悬液的退热效果很好，一般在半小时之内会出现明显退热，但退热时间维持不稳定，大约4到6小时，但是该药用药间隔至少4到6小时，24小时运用最多不能超过四次，并且使用该退热药物的时候，一定及时给宝宝补水，避免造成脱水，另外要遵医嘱使用。
不提倡给发热的儿童用酒精擦拭身体，因为酒精可以通过皮肤吸收，吸收到体内会对儿童的肝肾功能造成影响，另外酒精通过皮肤吸收以后会影响孩子应用头孢类的抗生素，如果应用了的话，会导致出现双硫仑样反应，出现严重的并发症，所以儿童发烧时不建议用酒精擦拭身体。
如果宝宝腋下体温在37.3-38度之间，认为是低烧，这时多让宝宝休息，多喝水，增加机体代谢即可。当温度不超过38.5度，采用物理降温的方法即可，在没有冷风直吹的情况，脱去过多的衣服或松开衣服，利于散热。
用温毛巾擦拭患儿的面部、颈部、双腋窝及双侧大腿根部，擦拭时间要持续大约15分钟左右，擦拭时间过短，不利于降温。另外，在擦拭的同时，注意加强护理，避免受凉，尤其是腹部。
发烧一般是指发烧。急性上呼吸道感染、流行性感冒都会导致儿童半夜发热。具体分析如下：
1.急性上呼吸道感染：急性上呼吸道感染又称感冒，主要表现为鼻腔、咽、喉三个部位的急性炎症，主要表现为发热、咳嗽、流鼻涕。儿童夜间出现急性上呼吸道感染，可能会出现半夜发热的症状。建议家长及时带孩子去医院就诊，在医生的指导下服用小儿退热颗粒、小儿感冒颗粒、小儿氨酚黄那敏颗粒等药物。
2.流行性感冒：流行性感冒是指流行性感冒病毒引起的全身疼痛、发热、呕吐等症状。建议家长给孩子贴退热贴，多喝水，可以口服布洛芬颗粒、磷酸奥司他韦干混悬剂、利巴韦林颗粒等药物。
