巧克力囊肿不治会导致月经异常，月经稀少或闭经，有些病患表现月经淋漓不断；其次会影响少女形象，会出现多毛、肥胖、座疮等症状；并且还会导致不孕，多囊卵巢往往有持续性无排卵，不能自然怀孕，是女性不孕症的主要原因；最后是女性如果妊娠，妊娠高血压综合征和妊娠糖尿病的风险明显增加。
巧克力囊肿坚持做仰卧起坐有利于疾病的治疗，并能有效地锻炼腹部肌肉，可以提高人体的抗病能力，可以有效地治疗疾病，并能防止疾病的复发，选择合适的锻炼方法根据身体条件，每天锻炼。能提高人体免疫力，预防疾病的发生，有助于疾病的治疗。
巧克力囊肿是子宫内膜异位到卵巢部位发生的一种病变，会出现腹痛和痛经，应及时到正规的医院检查和治疗，在治疗期间要注意少食辛辣食物，注意腹部的保暖，三餐要规律，定期做好复查。
巧克力囊肿可以吃鸡蛋。巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到了卵巢，是不影响正常的进食的，鸡蛋可以补充蛋白质，有利于组织的修复，可以养心安神，滋阴润燥，对病情是很好的，但是如果有腹泻，发热的症状就不能吃了。对巧克力囊肿也没有直接的不良作用。
卵巢巧克力囊肿，是子宫内膜异位到了卵巢引起的。直径在5厘米以下。囊壁容易反复形成小的破裂，破裂后囊内容物刺激局部腹膜及卵巢呈炎性反应，导致卵巢破裂处与周围组织黏连，导致卵巢固定在盆腔内。时间长了，还会引起输卵管粘连阻塞。一旦确诊是卵巢巧克力囊肿，还是尽早手术，防止时间长影响输卵管功能，影响生育。中医治疗效果不太好。
如果不I治疗，那么输卵管出现堵塞，卵巢囊肿会影响卵巢的正常功能，不能正常的进行排卵，同时体内激素水平也会失衡，破坏卵巢大部分组织，诱发输卵管堵塞。还会引起内分泌紊乱，卵巢器官在女性身体中是很重要的，一旦病变，就会使其临近的器官出现感染，破坏整个机体内部的循环。导致内分泌系统失调。
