原因是血栓性疾病，如脑血栓、冠心病、下肢静脉血栓等。同时在形成血栓前的状态，也会出现活化部分凝血酶原时间偏低。活化部分凝血酶原时间，是反映内源性凝血途径的指标。
活化部分凝血酶原时间偏高可能是参与内源性凝血因子的缺乏，如因子12，11，9，8，10，5，2和纤维蛋白原等。也可见于严重肝病如肝硬化或维生素K缺乏症病人，应用肝素或血液中出现了抗凝物质，活化部分凝血酶原时间也会偏高。
血浆凝血酶原时间偏低，常见于机体处于高凝状态，比如高血脂的患者、脑血栓、冠心病、心肌梗死的患者，都会出现血浆凝血酶原时间偏低的情况，往往代表机体已经发生或者很可能要发生各种血栓和栓塞性的疾病。
部分凝血酶原时间偏低，常见的原因是血栓性疾病，如脑血栓、冠心病、下肢静脉血栓等。在形成血栓前的状态，也会出现活化部分凝血酶原时间偏低。应通过口服抗凝类药物进行治疗。
一般情况下，出现血栓不会导致凝血酶原时间高。具体情况分析如下：
凝血酶原时间是反映外源性凝血是否正常的，由于血栓会导致凝血酶原时间下降，体内环境处于高凝状态，此时不能及时的进行治疗，会导致血栓的体积增大，病情也会逐渐加重。如果凝血酶原时间过长，就会造成体内的凝血因子不足，或是体内使用了肝素类的抗凝药物。
部分凝血酶原时间是反应内源性凝血途径的实验，正常参考范围为31－43秒，超过正常对照值10秒以上为异常。如果延长，说明参与内源性凝血途径的凝血因子有异常，如因子12，11，9，8，10，5，2和纤维蛋白原。也可见于严重肝病，维生素K缺乏症。
