新生儿在打完卡介苗后一般会出现发热和注射部位的皮肤红肿的不良反应，小部分新生儿有对疫苗过敏，可能会出现皮疹。如果体温不高，家长不要担心，加强护理和喂奶充分，体温会自行恢复。如果皮疹是散在出现的，也不需做任何处理，过几天就会自行减退。
新生儿注射卡介苗之后有脓包形成比较常见，卡介苗接种后的局部反应和其他疫苗有所不同。绝大部分新生儿接种卡介苗之后1-2周或者3-4周会出现局部的反应，局部经过红肿、脓包形成、破溃、结痂的过程。
一般来说，新生儿卡介苗出生后打一次。
婴儿在一岁之内必须要完成卡介苗的接种，一般来说，新生儿卡介苗出生后打一次。卡介苗接种后两周左右，在新生儿上臂的接种部位，局部可以出现红肿侵润，约8-12周之后就结痂。
需注意的是，在急性传染病的恢复期、有全身性的皮肤病，或者新生儿的上臂局部有湿疹的情况下，是不能接种卡介苗的。
卡介苗开始红肿时，不需要任何处理，开始出现脓包没破溃时，也不需要处理，洗澡穿衣的时候特别注意别弄到那里就好。包破溃时也属正常反应，无需紧张，可用无菌棉球蘸干局部，保持局部透气等待结痂。
卡介苗和乙肝第二针可以一起打。
我国计划免疫规定胎龄≥37周,出生体重≥2500g的新生儿,出生后要接种卡介苗。接种有胎龄和体重限制,胎龄和体重都不达标建议延迟接种。通常3个月内的卡介苗可以直接接种。月龄3个月到3岁,要做PPD试验,阴性才能补种。乙肝疫苗通常是出生后打的第一针,1个月时打一针,6个月时打第二针。出生时卡介苗和乙肝疫苗可以同时接种,若出生时没有接种卡介苗,1个月时可以和乙肝疫苗一起接种。同时接种卡介苗和乙肝疫苗不会降低免疫效果,同时接种有助于提高乙肝病毒阳性母亲生下的新生儿接种卡介苗的效果。
理论上来讲卡介苗和乙肝疫苗第二针是可以同时接种的。卡介苗是由减毒牛型结核杆菌悬浮液制成的活菌苗，具有增强巨噬细胞活性，加强巨噬细胞杀灭肿瘤细胞的能力，活化T淋巴细胞，增强机体细胞免疫的功能。乙肝疫苗用于预防乙肝的特殊药物。疫苗接种后，可刺激免疫系统产生保护性抗体，这种抗体存在于人的体液中，乙肝病毒一旦出现，抗体会立即作用，将其清除，阻止感染。两种疫苗在理论上来说，不糊产生冲突。可以一同接种。不过两种疫苗不能混合在一起接种，也不能接种在同一部位，可以在人体左、右上臂各自注射一针。
