阴茎流脓尿痛可能是淋病或非淋病尿道炎的疾病。需要及时的去医院检查，对症治疗。这期间要注意饮食清淡，多喝水，多吃新鲜的蔬菜和水果。还要适当的锻炼身体，提高自身的免疫力。
单凭脓尿可以诊断尿路感染，尿路感染是人群当中非常常见的一种疾病，通常是由于细菌感染所引起的，在进行鉴别的时候，需要进行尿常规检查和泌尿系统彩超检查，尿常规检查当中，白细胞明显高出正常参考值，可以证实存在细菌感染。
脓尿是乳白色的。严重时可以有脓块，一般常见于尿路感染。如果离心尿液中白细胞数大于等于每高倍镜下视野10个，就可以诊断为脓尿。脓尿的诊断标准即尿沉渣检查时每个高倍镜视野白细胞和脓细胞数均大于5个。
尿液中的白细胞是非常少的，一般10ml的洁净中段尿离心，每次高倍镜视野的白细胞数大于5。
尿常规正常，或者在临界值以下可以进行12个小时的计数，尿中白细胞超过100万个为异常，3个小时清段尿检测1小时尿中的白细胞排出率低于200000是正常的，大于400000属于脓尿。尿液中含有的白细胞的多少决定了脓尿的严重程度。
如果只有少量的白细胞，则是镜下脓尿，而含有大量的白细胞，则是肉眼可见的乳白色或肿块。
考虑是尿道炎的可能性和久坐憋尿，饮食辛辣刺激，不洁的性接触都有密切的关系需要进一步的检查尿常规，尿道分泌物的培养，明确致病微生物的种类和药物敏感性，选择适当的药物治疗。
阴茎流脓尿痛有可能是因为尿道炎症引起的，如果是有不洁性行为也需要注意性病的可能性的，可以考虑采用酸钾溶液进行清洗，另外就是要注意个人卫生，暂时避免性生活，如果持续不康复需要及时就医。