毛囊炎的治疗要因病施治，因为毛囊炎的原因，包括细菌、真菌以及刺激，还有原因不明等。对于细菌性的毛囊炎，主要以抗生素软膏为主，对于真菌性的毛囊炎，以抗真菌药物为主。
毛囊炎的反复发作被认为与皮脂腺分泌旺盛有关。皮肤可以彻底清洗、消毒，并用完美的芦荟凝胶外用。不要使用太油腻的护肤品，选择清爽保湿的化妆品，并注意饮食习惯。有些太油腻和刺激性的食物暂时不应该吃，这有利于毛囊炎的治疗。头皮上的毛囊炎反复发作，可因皮肤细菌或丙酸杆菌感染毛囊引起。主要和机体的免疫力低下有关系的。
阴部毛囊炎可以使用药物等办法治疗，具体分析如下：
阴部在日常生活中容易受到尿液，白带，粪便等的排泄物，会让外阴长期处于潮湿的环境中，同时也会因为不注重个人卫生，不经常换洗内裤，从而导致阴部毛囊受到细菌感染，从而引起毛囊炎。建议患者按医嘱使用金霉素软膏、阿莫西林胶囊等。在治疗的时候要避免食用辛辣刺激性的食物，平时要多换内裤，避免穿紧身衣。
主要是皮肤的毛囊炎，是没有注意清洁卫生造成的局部皮肤细菌感染。目前是没有什么偏方的，需要患者积极的抗感染治疗才行，主要是积极的使用抗生素软膏，同时还要注意清洁卫生才行，不然可能会导致感染的加重。
毛囊炎一般是细菌感染引起的，可以用消炎杀菌的外用洗剂或无菌盐水清洗，严重的话需要配合口服抗生素药物，注意局部卫生，不要抓挠，以避免化脓感染，饮食上尽量不要吃辛辣刺激性食物和过于油腻的食物。
毛囊炎脱发在治疗之前需要化验脓汁细菌培养以及药敏，找到相应的致病菌，并且找到对应的抗生素治疗，效果比较好。可以应用抗生素软膏，如果有较大的囊肿以及结节，还可以口服胶囊。需要忌食甜、辛辣刺激的饮食。
