一般情况下，宝宝消化不良会腹泻的原因有食物不当、感染等。
1.食物不当：宝宝消化不良时，肠道中不消化的食物增多，从而使肠道内水份增加，而且食物一般会释放一些酸性物质，刺激肠蠕动，从而引起腹泻。
2.感染：当宝宝消化不良的时候，容易出现继发肠道细菌感染、病毒感染等情况，从而出现宝宝消化不良会腹泻的的情况。
一般经过治疗后，拉肚子没有任何改善，首先要看孩子的身体状况，如果孩子的身体状况良好，没有明显的精神和发育不良的表现，就说明孩子是拉肚子了，可以通过改变孩子的饮食习惯来改善。但是，如果孩子出现了体重下降、慢性低烧等情况，可能是感染性疾病，需要通过粪便进行培养，然后根据病原菌的种类来进行针对性的治疗。平时少吃辛辣刺激的食物，保持充足的睡眠，少熬夜。
小孩腹泻不一定是消化不良，是多病原、多因素导致的。
腹泻的特点是大便次数多，大便性状改变，有发热、呕吐、腹痛等症状，还有水电解质酸碱平衡紊乱。细菌、病毒、大肠杆菌、侵袭性大肠杆菌、出血性大肠杆菌、空肠弯曲菌、伤寒沙门氏菌、军浦菌等寄生虫真菌是主要的病原。滥用抗生素导致肠道菌群紊乱、喂养不当、过敏、气候因素也是致病原因，2岁以下婴幼儿常见。要合理饮食、维持营养、控制肠道感染、对症治疗、纠正水电解质平衡紊乱、加强护理、不能滥用抗生素、防治并发症为主要的治疗方式。建议继续母乳，可以进食，人工喂养婴儿年龄6个月的婴幼儿，在平日习惯的饮食基础上，除了粥、面条外，可以添加果汁或水果以补充钾。不吃不容易消化的食物，腹泻严重或呕吐严重的4-6个小时要禁食，不用禁水，禁食6小时内，及时恢复饮食。
平时要注意宝宝饮食，养成良好的饮食习惯及生活习惯，要注意少吃多餐，吃容易消化的食物，养成良好的饮食习惯。避免吃生冷、油腻、粗糙、含纤维素比较多的食物，不要暴饮暴食。吃饭时提醒宝宝要细嚼慢咽，这样有助于消化吸收，从而减轻胃肠道的负担。另外可以给孩子去医院做一个大便常规检查，积极使用药物治疗，因为反复腹泻容易导致出现营养不良，或者是出现缺钙的情况。
两岁宝宝消化不良拉肚子首先要调整好生活习惯，不要食用寒凉的食物，例如：牛油果，香蕉，奇异果，火龙果等，不要食用冰激凌，冷饮等生冷的食物，以免引起肠胃不适。平时要吃的东西要清淡易消化，不能吃太多的食物，容易导致孩子的肠胃出现问题。另外还可以通过服用一些促进消化的药物和益生菌来调整肠道菌群，比如胃酶合剂、酵母片等，布拉氏酵母菌、三联活菌等都是比较常见的。
宝宝出现拉肚子咳嗽发烧症状，多数是消化系统炎症刺激或者呼吸系统炎症，需要检查一下胸部x光片，血常规，大便常规进行确诊，给宝宝吃一些健脾益气类的药物，可帮助孩子健脾和胃，提高孩子的胃肠道消化吸收的能力。
