碘具有杀菌力强，能杀死芽胞、真菌、原虫、病毒等作用。故其对粘膜及皮肤有一定的刺激性。通常用2%碘酊用于一般皮肤消毒或皮肤感染；3.5%~5%用于手术野皮肤消毒，碘可融于酒精稍干后再用酒精脱碘，防止碘刺激皮肤引起发泡及脱皮，甚至引起皮炎，碘过敏者，可引起全身的皮疹反应。
给宝宝脐带消毒时，较常用的是碘酒，碘酒的挥发性、刺激性小，每天消毒两次早晚各一次。也可以用碘伏先消毒，再用酒精脱碘。用酒精脱碘时用棉球在肚脐中心，以转圈的方式向外擦，能够起到脱碘、消毒的作用。
碘酊具有强大的杀菌作用，一般取2%浓度用于注射部位皮肤消毒或早期疖肿的消炎，但有较强的刺激性、腐蚀性，所以用于皮肤消毒后应以70%酒精擦拭脱碘，且禁用于黏膜或伤口内消毒，否则会引起剧痛和红肿。因此碘酊脱碘的原因就是碘酊有较强的刺激性、腐蚀性，并且有些患者对碘过敏，用后及时脱碘可以防止碘造成过敏。
龟头炎可以使用碘伏外涂治疗，碘伏除杀菌作用，还有一定的抗真菌作用。杀灭能力相对较强，而且碘伏对皮肤黏膜刺激性相对较小，可以用于阴部皮肤外涂治疗。禁忌使用酒精制剂，如碘酒或医用酒精等治疗，因为碘酒及酒精内均含有刺激皮肤黏膜的酒精成分，可引起黏膜疼痛或红肿等现象。
一般情况下，伤口有脓不能用云南白药，几乎没有治疗效果，具体内容如下：
若有脓水，使用云南白药并无多大作用。一般是采取通畅引流，将伤口表面的脓液、坏死物等清理干净，尽量做到看到有血迹的表现，还可以在医生指导下选择合适的抗生素进行治疗，也可以使用营养丰富的食物来增强身体的抵抗力。因此，如果伤口出现脓液，需要到专业的专业机构进行检查，确诊后再进行有效的治疗。
一般情况下，在有外伤出血的情况下，可以在伤口上撒云南白药粉进行治疗，有非常好的疗效。
云南白药粉撒伤口会出现疼痛的症状，属于正常现象，疼会自然停止的，如果疼痛症状比较严重，所以建议将药粉清除，同时进行消毒清创，露出新鲜的创面，然后用无菌的纱布包扎。如果疼痛，可以配合服用非甾体类消炎止痛的药物，缓解疼痛。
