肛肠镜检一般不会引起疼痛，但会有下腹部及肛门处胀胀的感觉病人可以耐受。镜检时会在肛门镜外壁涂抹石蜡油起到润滑的作用，方便镜子进入肛门。但如果肛门有病变，如肛裂、肛周脓肿、外痔及内痔炎症感染时，肛门镜检会因肛门镜摩擦病灶而出现疼痛不适。尤其是肛裂病人疼痛剧烈，原则上该类不予肛门镜检。
不麻醉会有一定的疼痛感，如果紧张可以选择在麻醉状态下做。膀胱镜检查是将膀胱镜经尿道插入膀胱，以直接观察膀胱和尿道内病变的检查方法。手术中，需要放松心情，女性病人和用扩阴器做妇检一样，镜头可沿着尿道的生理弯曲度自然地进入，观察膀胱各个部位的病变从而进行检查。
做气管镜检查的时候，会有一定的不适感，但是，针对这种不舒服的感觉可以采取局部麻醉，使声门及会厌部的不舒适感减退，如果仍无法耐受时，也可采取全身麻醉后再做气管镜检查。
肛镜检查有轻微的痛苦，主要是与检查水平和检查态度有关，另外，与肛门口的大小，肛门及直肠的发育程度都是有一定的关系的。掌握了技巧，动作温柔，进入的角度正确，配合良好，肛镜做好充分的润滑，疼痛不重，有轻微的胀痛感。如果肛门狭小，可能疼痛的情况就比较重。
不用，对病症来说是没有任何影响的，所以我们不用担心做检查的时候不能空腹，保持患处卫生，不穿过紧内裤，按时清洗，忌手淫和性生活，多喝水，多排尿，有利于病情恢复快，不吃辛辣和生冷食物，忌烟酒。
