扁平疣治疗上可以用物理疗法或药物疗法、中医中药疗法等。物理治疗主要选用液氮冷冻和激光治疗、疣组织包埋疗法。中医中药疗法有耳后放血法、火针法、穴位注射法等。药物治疗可以服用增强免疫的药物，因为扁平疣多发生于免疫力低下人群，免疫力增强后，有自身清除病毒的可能，扁平疣是有自愈性的。
扁平疣是一种人乳头状瘤细菌。因此，如果患有扁平疣，要吃一些能清热解毒的食物。不要吃辛辣刺激的食物。对于已经形成的扁平疣，可以通过激光手术治疗。治疗后，必须注意皮肤护理。不要碰水。不要刺激皮肤，一般1-2周后会缓解。也要保证充足的睡眠，不熬夜，适当运动，提高身体免疫力。避免过度劳累。
这个疾病相对危害还是比较大了，因为扁平疣是由于病毒感染引起的，对自身的危害也是比较大的，如果不治疗扁平疣会越发变多的，所以确诊感染此病后建议及早进行有效的治疗才行。对人的外貌影响很大，同时也会传染。
要忌口。在过程当中辛辣刺激的食物是不能吃的，其他食物没有特殊的要求，可以正常食用。扁平疣主要是免疫力低下引起的，所以平时要注意休息，饮食以清淡为主，多吃水果蔬菜，不要熬夜。
扁平疣一般通过药物治疗、物理治疗等方式去除最好。
扁平疣是由人乳头状瘤病毒感染所致的一种良性皮肤赘生物。多见于颜面、颈部、前臂及手背等处。患者可以遵医嘱外用维A霜、咪喹莫特等药物改善症状，还可以通过液氮冷冻治疗、二氧化碳激光等方式进行物理治疗。
日常避免饮酒，外出要做好防晒工作。
扁平疣通常情况下可以在医生指导下通过外用维a酸软膏、他扎罗汀乳膏、激光等方式治疗。
1.外用维a酸软膏：扁平疣一般情况下可以把维a酸软膏直接涂抹在扁平疣上面，能用于促进表皮脱落，对扁平疣有一定效果。
2.他扎罗汀乳膏：扁平疣做完清洁之后可以在医生指导下外用他扎罗汀乳膏，能达到修复扁平疣作用，可以达到去除扁平疣目的。
3.激光治疗：扁平疣可以到正规医院皮肤科做激光治疗，通过光热效应可以达到去除疣体作用，达到去除扁平疣效果。