阴茎短小的治疗方法包括生理性阴茎短小，多见于耻骨联合部、会阴部脂肪较多的男性，可通过手术治疗，去除多余的脂肪，使阴茎得以延长至正常长度，病理性阴茎短小，染色体异常、克氏综合征、卡尔曼综合征导致的阴茎短小，应及时就诊，明确病因，对症治疗。
一般情况下，男性的阴茎短小，可以在医生的指导下通过药物治疗、手术治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
阴茎短是一种常见的诊断标准，成年男性的阴茎长度小于4cm，勃起时长度小于8cm。遗传因素、肥胖、雄性激素分泌下降、营养不良等都是导致阴茎短小的主要原因。比如加强营养、外源性雄激素（口服十一酸睾丸酮等）、减肥等。阴茎整形延长手术是由于生殖器畸形引起的阴茎短小。
阴茎短小可以做个手术延长，将阴阜部位的隐藏阴茎暴露出来，可以延长三厘米左右，平时也可以穿英国卫裤。平时保持良好的生活饮食习惯，多吃些营养的食物，适当增加高蛋白饮食。
阴茎的长度存在个体差异。一般来说，如果勃起的长度大于8cm以上，这种情况不影响性生活，这样可以不用处理。他对性生活没有影响，如果说勃起长度小于8cm，影响性生活的情况可以采取手术的治疗办法，一般药物对阴茎短小没有帮助，唯一的办法就是考虑手术治疗，可以考虑假体植入，还有一部分是因为隐匿性阴茎造成的阴茎短小，这种情况也可以考虑手术的治疗办法，将隐匿的部分采用手术的办法拉出来。
男性阴茎短小可以考虑及时的到医院进行阴茎的延长手术。阴茎大小和遗传关系很大，如果影响夫妻生活，可以做个手术延长，将阴阜部位的隐藏阴茎暴露出来，可以延长三厘米左右。