一般情况下，腱鞘囊肿口服消炎镇痛的药物进行治疗。
病情急性发作的时候可能会产生疼痛，患者可以口服消炎镇痛的药物来消肿、止痛。急性期过后，如果病情严重需要通过手术来切除腱鞘囊肿。
如果不采用手术切除的方式，腱鞘囊肿容易反复消失和存在。
建议治疗期间，患者应该规律作息，保证充足的睡眠，避免熬夜，除了针灸，还可以通过按摩、理疗等方式血液循环，缓解症状。
腱鞘囊肿部分可以自愈，有一部分严重的不能自愈。
肌腱囊肿与腕部的过度疲劳、或是长期患有关节炎等相关的病症有关，其中腱鞘囊肿与其它的病症相比具有自我修复的趋势，一些不需要进行有效的处理就会自行消失。腱鞘囊肿并不是特别的严重，可以通过推拿来减轻肿痛。如果病情加重，并且腱鞘囊肿过大后很难恢复，并且会造成更大的损伤。
因此，如果是不能自行消失的腱鞘囊肿，可以通过针灸和外科的方式来进行，而外科治疗通常是用于针灸来解决无效的。
如果腱鞘囊肿患者没有出现明显不适症状，可以不进行特殊的治疗。若出现不适症状或并发症时布不治疗，可能会导致病情加重。
腱鞘囊肿是一种良性的肿瘤，一般不会对人体产生任何的伤害，所以不需要特别的处理。但如果是大关节的腱鞘囊肿，会影响到关节的运动，尤其是扩张之后会压迫到神经血管，那么囊肿就需要进行特殊的治疗，将腱鞘囊肿去除，以消除压迫组织，恢复四肢的运动，缓解四肢的麻痹，改善四肢血液循环。
典型表现为腕部、足背部等局部皮下圆形或椭圆形囊性肿物，一般无痛。是可以进行挤压的，可以自己轻轻按摩囊肿，但避免暴力挤压或用重物敲击囊肿。腱鞘囊肿的发生可能与局部损伤或劳损有关。腱鞘囊肿一般不会有明显的表现，只要多注意休息和观察即可。
但是随着腱鞘囊肿的增大，出现了相应的神经、血管等症状，要及时的进行治疗，可以采取穿刺抽吸-药物注射法、手术治疗、关节镜治疗等方式进行治疗，以免损害机体的健康。
通常情况下，腱鞘囊肿中医可以通过使用药物、针刺治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
使用药物：腱鞘囊肿中医治疗时，可以安静消炎镇痛膏、麝香止痛贴膏、云南白药膏等把膏药敷到患处，可以起到消肿化脓、活血行气的作用。
针刺治疗：腱鞘囊肿中医治疗时，根据囊肿的部位及症状，选择合适的穴位，可以很好的治疗腱鞘囊肿。
脚踝腱鞘囊肿可以通过针刺、药物治疗等方式改善。
脚踝腱鞘囊肿要根据囊肿的体积和局部的压力来决定，如果囊肿很小，直径小于2cm，可以采取保守疗法，比如在外用热敷，可以用针刺，进而可以对局部进行封闭，但是对于大的腱鞘囊肿，或是压迫到了周边的神经动脉，引起了足趾的麻木和痛苦。这时需要进行药物治疗，起到止痛的作用。
