两种药有不同的适用方向。阿莫西林主要对上呼吸道疾病、支气管炎等全身感染性疾病效果比较好，而头孢克肟主要用于下呼吸道感染效果比较好如肺炎等。一般感冒的初期病程都是鼻塞，流鼻涕，发热，咳嗽等上呼吸道感染症状，所以只能在前期按模型体现出主要的治疗效果。
阿莫西林胶囊是种消炎药，可以治疗各种原因引起的炎症。溶血链球菌、肺炎链球菌、葡萄球菌或流感嗜血杆菌所致中耳炎、鼻窦炎、咽炎、扁桃体炎等上呼吸道感染。大肠埃希菌、奇异变形杆菌或粪肠球菌所致的泌尿生殖道感染。
阿莫西林属于抗菌药，半合成青霉素类中的广谱青霉素类。对于革兰氏阳性和阴性菌均有杀菌作用，和青霉素G疗效相当，但是抗菌谱广。而消炎药一般医学上所指的是解热镇痛抗炎药。
头孢克肟胶囊和阿莫西林都属于一种消炎药物，阿莫西林属于青霉素类的，头孢克肟片是属于头孢类的药物，他们都是消炎药，但是不是一类药，治疗发烧感冒，头胞克肟效果好点。
头孢克肟和阿莫西林，都是抗生素用药，阿莫西林是一种最常用，应用较为广泛的口服半合成青霉素，口服吸收好，容易耐药，头孢克肟是第三代头孢类，具有抗菌谱广、抗菌作用强、耐青霉素酶、过敏反应较阿莫西林少见等优点，可用于一些比较严重的感染。
可以按照临床医生的医嘱，结合孩子的具体情况来针对性的对症治疗。服用药物期间多喝温开水，多吃新鲜的蔬菜和水果，补充维生素，不要吃一些刺激的食物，比如油炸食品，注意休息。
