新生儿接种乙肝疫苗需要在第一天接种第一针，第二针在30天内打第二针，180天打第三针。
现在普遍认为三次乙肝疫苗能够促进人体的免疫，从而降低乙肝病毒的感染几率，降低母亲的垂直传播的危险。不过，接种了乙型肝炎疫苗并不意味着就能得到保护的抗体，而保护性抗体的生成与自身的免疫力有关，因此需要在一周岁左右做一次血液检测，检测到乙肝两对半，以确定是否得到了保护的抗体，如果乙肝表面抗体为阴性则需要进一步接种。
乙肝疫苗在注射第一针后，30%的人产生表面抗体，第二针后50到70%的人产生表面抗体，第三针90%的人产生表面抗体。在全程注射完乙肝疫苗一个月后，应再次检测乙肝表面抗体产生抗体。
不存在乙肝疫苗抗体的说法，如果有乙肝抗体，通常不用打疫苗。
目前临床上还没有乙肝疫苗抗体的概念，只有乙肝表面抗体，乙肝两对半的检测结果是乙肝表面抗体阳性，则说明存在乙肝表面抗体，此时不需要再打疫苗。不过，也有一个特殊的现象，那就是随着时间的流逝，乙肝表面抗体的浓度会降低，或者会转成阴性。因此，如果有乙肝的高危因素，即患者的家人有乙肝病毒感染，应定期进行乙肝两对半的检查，如果发现乙肝表面抗体转阴，需要再次接种乙肝疫苗，以便得到乙肝表面抗体的持续阳性，从而降低乙肝的感染几率。
注射乙肝疫苗后，人体免疫系统会对疫苗中的蛋白质抗原产生反应，一般在注射疫苗后大约一个月左右就会产生抗体，刚开始抗体水平很低，到了第二针，抗体水平就会迅速上升，很快就能抵抗乙肝病毒感染。接种乙肝疫苗后，从理论分析半个月后会逐渐产生抗体。不过早期抗体的浓度比较低，接种三针结束后，90%以上的患者都会出现保护性抗体。
注射乙肝疫苗后通常会产生抗体。
一般来说，注射乙肝疫苗后，大多数人都会产生乙肝抗体，但还是有少部分人会产生抗体，这可能与身体对乙肝疫苗的反应弱有关，或者本身就感染了乙肝病毒。乙肝病毒携带者表面抗原呈阴性。乙肝病毒携带者打疫苗时不会产生抗体，所以要定期检测乙肝病毒DNA。如果病毒呈阴性，可以考虑打加强针加强乙肝疫苗的刺激，看是否会产生表面抗体。
乙肝核心抗体阳性能打乙肝疫苗。
乙肝核心抗体呈阳性，但抗体滴度较低，可能是假阳性，所以可以接种乙肝疫苗，另外，如果核心抗体滴度较高，一般是在乙肝病毒感染的恢复期，经过一段时间后会主动产生表面抗体，所以不需要接种乙肝疫苗。还有就是抗病毒治疗，导致乙肝病毒逃逸性变异，此时不仅核心抗体呈阳性，而且乙肝病毒DNA呈阳性。
