通常手术是尿道下裂的首选方法，
尿道下裂患者通常建议在18个月左右开始手术治疗，对于阴茎发育不良的患者，外科手术之外还可以使用药物进行辅助治疗，比如用绒毛膜促性腺激素等。如果伴有阴茎发育短小、阴囊分裂、阴茎弯曲等症状，可以通过阴茎增粗、阴茎延长、阴囊分裂纠正、阴茎矫直等方式进行治疗。
此外，患者应该注意局部的清洁卫生，有助于促进术后恢复。
婴儿尿道下裂可以治好。
一、冠状沟型尿道口下裂，患者有这种畸形，尿道外口在冠状沟腹侧，即阴茎头后凹陷腹侧。
二，阴茎体型尿道口下裂，这种畸形症状复杂，尿道外口可能在阴茎体腹侧的任何部位，阴茎向腹侧弯曲畸形。
矫正尿道口下裂的手术建议3岁前做，3岁前孩子不懂事，此时手术对孩子心理没有影响。若孩子有隐睾要及早手术，治疗不及时会影响睾丸发育，若在幼儿园时期才手术，孩子心理上可能会有伤害。
尿道下裂首选疗法为手术，手术时间尽可能早，由于小儿修复和愈合能力较强，而疼痛的回忆愈小。如果年龄较大时，可选择其疗法来进行辅助治疗，如留置导尿等。建议在1岁以后进行手术，最常采用的术式是在阴茎背侧使用冒状包皮卷管，完成尿道成形术后，对阴茎发育较挺直者，尿道板纵切卷管尿道成形术可用于尿道。
此外，婴儿尿道下裂应该注意局部卫生，避免方式感染。
宝宝尿道下裂建议手术治疗，最好2-3岁接受手术。
目前也有人建议一岁半前手术，避免遗留心灵创伤。若阴茎发育小，促进阴茎发育可以用激素，创造手术条件。手术主要是阴茎下行矫正、尿道外口处于正常的位置、术后阴茎勃起不痛、没有尿瘘和排尿困难情况、可以站立排尿、阴茎的外观接近正常、成年后能正常地的同房。尿道下裂要具体分析后进行手术。阴茎头冠状沟型、尿道外口冠状沟、腹侧轻度尿道下裂，没有阴茎下行不用手术，但多数尿道下裂要手术矫形。
胎儿尿道下裂一般及时治疗是不影响生育的。
想要能够有正常夫妻生活，尿道外口要移到龟头正中或阴茎龟头上，这样有利于精子进入女性体内，其次是可以无疼的勃起。如果是严重的尿道下裂或者阴茎体、阴囊、会阴等部位下裂，那一定会对生育造成一定的影响，但只要处理得当就能解决。做手术时，尿道的材质必须要经济，不要经受长时间的尿液侵蚀，而且要有良好的血液循环，这是恢复的基础。
一般情况下，宝宝尿道下裂如果生后治疗得当是不影响生育的，但是需要积极配合治疗。
先天性的尿道畸形，一般认为是由于胚胎时期睾丸产生的雄性激素不足所造成的。如果是严重的尿道下裂或者是阴茎体或者是阴囊，会阴部位的尿道下裂肯定会影响生育的，需要积极进行手术治疗，这样能够恢复正常的排尿以及生育能力，手术应该要尽早性进行。
