一般情况下，小孩衣原体肺炎主要是用大环内酯类药物进行治疗。
如果咳嗽咳痰并且伴有发烧症状，建议还是静脉输液治疗，主要是用大环内酯类药物进行治疗，常用药物有阿奇霉素、克拉霉素等。同时，患儿同时可有发热等伴随症状，需给予对乙酰氨基酚、布洛芬等药物进行对症处理，多吃一些新鲜的瓜果和蔬菜，避免烟雾和寒凉刺激。
阿奇霉素、红霉素、克拉霉素等是治疗肺炎支原体的首选药物；还可以口服莫西沙星、左氧氟沙星等喹诺酮类的药物；如果情况比较严重的话，可以配合激素进行短期小剂量的药物，这样才能使症状得到改善。需要注意的是，用药前应进行药敏试验，以便选择合适的药物治疗。
衣原体肺炎为肺炎衣原体引起。
衣原体包括沙眼衣原体，肺炎衣原体等、鹦鹉热衣原体，以及家畜衣原体。导致肺炎的衣原体有两种，大多是肺炎衣原体、偶有鹦鹉热衣原体引起，衣原体可通过呼吸道分泌物，飞沫等途径进行传播，可能会有小规模流行。
肺炎衣原体肺炎容易继发感染，导致呼吸系统损害，建议及时就医诊治。
小儿支原体肺炎是由于支原体感染引起的，这种病原体感染以后，在体内被彻底清除干净是非常困难的。会出现反复的咳嗽，发热，有的甚至会出现喘息，出现肺外并发症的概率是非常高的，这种疾病需要使用抗感染治疗，如果咳嗽的症状比较严重，可以使用雾化吸入缓解咳嗽症状。
支原体肺炎应该通过以下几方面进行检查，一、体格检查，查看患者是否有鼻咽部充血的病症，而且还伴有淋巴肿症的症状，用听诊器听出肺部有细湿罗音，可以判断是肺部支原体感染，二、通过胸部ct和x光片进行检查，如果发现肺纹理增粗，并且有肺实质性侵润象，提示是肺支原体感染三、血液检查，查看白细胞数量是否在正常范围内，但是中性粒胞偏高的现象说明有支原体肺炎。
肺炎衣原体是肺炎的一种。肺炎分为细菌性肺炎、病毒性肺炎、真菌性肺炎、衣原体性肺炎、支原体性肺炎等。需要进行痰培养和药敏检查，看哪个药物对症比较敏感。咳嗽、咳痰、发热等症状，胸片或肺部CT显示有轻微的间质性变化，衣原体抗体在最近4倍以上，可以诊断为肺炎衣原体感染。可以选择阿奇霉素、大环内酯类的红霉素，也可以选择喹诺酮类的药物，比如左氧氟沙星，比如莫西沙星。
