一般情况下，引起慢性直肠炎的病因有很多，应在辩证的基础上，明确病因，根据病因，对症治疗。
口服药物有时候是中成药，有时候是中草药熬制成汤剂，中成药用的比较多的是肠炎宁，归脾丸，补充益气丸等。中草药一般是具有清热解毒，消肿散结，消炎止疼的功效，临床上比如黄连，黄芪，党参，蒲公英，五倍子等。也可以用以上中药煎汤灌肠治疗。取足三里、上巨虚、天枢穴、合谷穴等穴位。
引起直肠炎的由于长期过度疲劳、情绪激动、过度精神紧张，加以营养不良。夏季很容易引发直肠炎，直肠炎轻者仅粘膜发炎，重者炎症累及粘膜下层、肌层，甚至直肠周围组织。直肠炎病症不同会有所不一。
慢性直肠炎需要中西医结合来治疗效果比较好。注意饮食的调节，一定要吃容易消化食物，过凉的、过硬的、辛辣刺激的食物都不能吃，主要是管住嘴，再服用中药补气的药。避免受凉，控制情绪外，不进食豆类及豆制品，麦类及面制品，以及大蒜、韭菜、洋山芋、皮蛋、卷心菜、花生、瓜子等易产气食物。
如果形成血栓，可以引起明显的疼痛，此时药物治疗是没有效果的，需要考虑及时的手术，可以到肛肠科就诊，医生会根据情况给出合理的治疗意见，平时一定要养成多喝水，多吃蔬菜水果，保持大便的软化，要积极配合医生的治疗。
慢性的直肠炎，属于良性的改变，也不是很严重的疾病可以考虑选择消炎药治疗的，另外就是注意个人的习惯了，尽量地不要吃辛辣刺激的食物，另外就是生冷刺激的食物也少吃，多喝水保持大便通畅。
慢性直肠炎是一种原因并不很清楚，反复发作的慢性疾病。从现在有的临床的研究来看，并没有一种治疗可以导致它治好不再发作。但是慢性直肠炎是可以临床控制症状的，通过药物治疗包括灌肠、口服药物以后能达到临床没有任何症状。通过饮食以及生活调理，还有避免诱因的出现来长期的让它不发作，这样对于慢性直肠炎也就叫临床控制了。
