巧克力卵巢囊肿一般指子宫内膜异位囊肿。通常情况下，子宫内膜异位囊肿目前为止病因还不清楚。子宫内膜异位囊肿是指卵巢内的异位子宫内膜组织周期性反复出血，形成被卵巢实质包裹的血肿，当具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢局部的时候，随着每次来月经异位症的病灶，在卵巢内也会出现出血的现象，患者可以通过囊肿剔除术、囊肿穿刺术、卵巢切除术等方式进行治疗。
左侧卵巢囊肿是否会影响生育，需要根据囊肿是否会影响卵巢排卵决定。
如果是单纯性卵巢囊肿不超过5cm，那么在来例假后就会自行消退，不会对排卵造成任何的影响。卵巢巧克力囊肿、囊肿比较大，没有正常的卵巢组织，会影响到卵巢的排卵，从而影响到生育。另外，卵巢巧克力囊肿属于子宫内膜异位症，会引起输卵管粘连、盆腔粘连，从而影响输卵管输送精子和卵子，从而引起不孕或宫外孕。
对于卵巢囊肿较小的女性，多数情况下都是可以同房的。一般的卵巢囊肿为良性囊肿，而且体积较小，在同房的时候可能不会有特别的不良影响。但如果女性的卵巢囊肿太大，在同房时就可能导致卵巢囊肿扭转或者破裂，可引起腹痛和出血。所以对于卵巢囊肿较小的女性，往往在非月经期都可以正常安排同房，但是在同房的时候不能够太过暴力，因为过于暴力也容易使卵巢囊肿破裂。
巧克力囊肿会引起女性小腹疼痛，痛经，性生活疼痛，阴道内不规则出血，盆腔器官黏连。输卵管阻塞，影响受孕几率，如果长期没有得到有效治疗，会引起女性贫血。巧克力卵巢囊肿属于子宫内膜异位，而子宫内膜异位是导致不孕的重要原因之一。
巧克力卵巢囊肿的危害是可能发生扭转，或是窥破，造成腹膜炎。所以巧克力卵巢囊肿一经发现就要到公立医院及时治疗，以免对身体造成危害，严重者影响生活质量，危及生命安全。
卵巢囊肿不会影响卵巢的，卵巢囊肿，一般与卵巢没有什么直接的关系，不会影响到卵巢的。卵巢囊肿是良性的，比较小的。定期复查超声，观察囊肿生长，如果囊肿生长加快或出现不适等症状，需要进行手术治疗，切除组织送病理检查，以进一步明确病变性质。
