引起胎停育的原因很多的，常见的是胚胎自身的原因，其次就考虑是否有内分泌失调，子宫内膜因素，染色体异常或者免疫因素引起的，或者有药物及情绪感染等因素引起的，进行内分泌检测及子宫内膜情况检查，查找原因再治疗。
胎停育的原因有，夫妻年龄较大，精子、卵子老化，因此受精后出现染色体不分离，使胎儿不能继续发育，还有一些家庭没有准备好要二胎，没有戒烟戒酒，一些身体有慢性疾病在服药期间，一旦怀孕也有可能发生流产和胎停育。
妊娠期生理状态的改变、使母体对治疗药物和各种环境有害物质的吸收、分布和排泄发生了较大的改变，在发育初期，胚胎对治疗药物和环境因素的影响极为敏感，此时各种有害因素都可导致胚胎的损伤、甚至丢失。
胎停育是指胚胎或者胎儿在母体内停止发育，引起胎停育的原因胚胎本身发育异常如染色体畸形等母体疾病如孕妇子宫内膜炎、贫血等外界因素，如新装修的房子、电离辐射、环境污染、磕碰撞伤等。准备再次怀孕，需要去相关部门做孕前优生检查，排除怀孕的不利因素，并服用药物预防胎儿畸形。
反复胎停育，很可能是夫妻双方任何一方有染色体异常，免疫功能异常。出现了反复胎停，一定要间隔至少一年以后再考虑备孕，采用些中草药调理身体，使身体的内分泌系统调理好在怀孕。
胚胎停育的原因主要因为胚胎早期发育的时候，需要三个重要的激素水平，一个是雌激素，一个是孕激素，一个是绒毛膜促性腺激素，如果母体自身的内源性激素不够，就会造成胚胎的停育。第二是生殖免疫的问题，如果自身有某种抗体，就会抵制胚胎的发育，建议做全面的孕前检查后再怀孕。
