生理性腹泻的原因是由于母乳内所含的某种营养成分，如蛋白质或脂肪，超过婴儿的需要，超过婴儿的消化吸收功能，而婴儿的消化能力发育健全，所引起的腹泻。此阶段的孩子常常会出现大便次数偏多，质地也比较偏稀，但是孩子的精神状态比较好，吃东西也正常且玩耍照旧。
小儿生理性腹泻时间为6个月以内。
生理性腹泻主要发生在六个月以内的婴幼儿身上，外观虚胖，长有湿疹，出生后不久就会拉肚子，一天大便数多到十来次，而且一次的便量并不是特别的多，而且没有特别的腥味，除了有一些湿气之外，并没有其他的表现。通常胃口好，没有呕吐，也没有任何的不良反应，在加入了一些辅助食品后，粪便和浊卷可以恢复正常。
生理性腹泻的主要症状是大便次数改变，一般不会出现营养不良、恶心、呕吐等症状，一般不会对身体的生长发育造成影响。
生理性腹泻可以在补充食物的情况下慢慢改善。生理性痢疾容易发展为感染性痢疾，一般表现为大便次数变化，应与感染性腹泻进行鉴别和诊断。生理性腹泻是婴幼儿常见的疾病，可以通过大便常规、血常规等检查来确诊。
婴儿生理性腹泻，多见于六个月以下的宝宝，出生后不久就开始腹泻，除了大便次数多以外，无其他症状，宝宝食欲良好，发育正常，外观虚胖，待孩子添加辅食后，大便渐渐转为正常，生理性腹泻不用药物治疗，注意护理就可以了，宝宝大便次数多，所以要勤换尿不湿，用温水洗臀部，保持臀部和会阴部皮肤干净，预防局部感染的发生。
生理性腹泻应当采取以下措施。
生理性腹泻是因为母乳中含有一些能够抑制乳糖酶的物质，导致孩子对乳糖的不耐受，导致出现了腹泻。如果无其他不适症状，一般无需进行特殊治疗。如果病情较为严重，可以在医生的指导下进行治疗，从而帮助缓解不适症状。
日常生活中，应当注意多饮水，多食用蔬菜和水果，饮食中适当增加纤维素。
如果腹泻过多，可以适当加用收敛剂或中药。若非必要，尽量还是少用或者不用药。对于明显腹泻的患儿，腹泻次数较大可以换用免乳糖奶粉。但如果腹泻较轻，建议继续母乳喂养。