有输卵管积水和巧克力囊肿，首先输卵管积水可以阻碍精子和卵子的结合，造成不孕，需要在腹腔镜下做输卵管疏通术，同时做巧克力囊肿挖出，保留卵巢就可以，这两个手术是可以同时进行的。
前者和后者都属于避孕类药物，从效果来看，两者避孕的效果都差不多。对前者和后者两种药物进行比较，要根据不同的情况、不同的病症，不能直接一概而论。两种药物成分基本相同。两者都是短效避孕药，只是答应三五的副作用相对大一些，口服期间不要漏服，如果漏服，需要及时补服，不然会容易引起阴道出血的情况，平时尽量放松心情，缓解压力，保证睡眠。
加强体育锻炼，增强机体抵抗力和免疫力。清淡饮食，少吃油腻刺激性食物，同房次数避免过频等。积极消炎治疗输卵管积水。考虑下药物和手术局部治疗的方法，临床实践治疗效果还是比较不错的。
输卵管积水粘连多是因为慢性炎症刺激所致，自然受孕可能性比较小。如果积水严重，除了会影响输卵管功能，影响卵子运输之外还会对子宫内膜产生毒性作用，影响受精卵着床，结扎或者切除输卵管之后做试管婴儿。
当双侧输卵管阻塞时，药物的治疗作用是有限的，虽然炎症是引起输卵管阻塞的原因，但造成不孕的直接原因是官腔机械性粘连阻塞，此时炎症多已不明显了，口服抗生素即使能消炎，但很难去除粘连。
输卵管积水，大多是因为输卵管的慢性炎症引起，往往伴有慢性腹痛病史，输卵管局部膨大增粗。而输卵管系膜囊肿，没有明显诱因，是位于输卵管与卵巢之间的系膜处，与输卵管无关，两者从查体上的表现，往往无法鉴别，因为都可以在一侧附件区触及增大的囊性包块，但是可以行B超及输卵管造影鉴别，也有一部分鉴别困难的需要手术中方能确诊。
