以消除病因、增强体质、对症治疗为主。治疗方法应该坚持全身治疗和局部治疗相结合，中西医治疗相结合，生理和心理治疗相结合，对症治疗。口服维生素B、C和增进机体的抵抗力，有助于溃疡的愈合。
口腔溃疡治疗一般是对症治疗，局部用治溃疡的药物，然后全身增强免疫力，加强体育锻炼增强体质。如果是精神因素造成，要自我调节，不要熬夜、挑食，多吃蔬菜、水果。也可以使用激光进行口腔溃疡的治疗，在诊室用激光对溃疡进行照射。
口腔溃疡属于一种病因不明的疾病，临床口腔溃疡由于病因不明，治疗的方案就是对症治疗。口腔溃疡临床治疗没有什么特效的疗效，一般七天左右可以自愈。补充维生素对口腔溃疡愈合有很大的帮助。
口腔溃疡很容易复发，所以不能够完全的治疗，但是可以通过正常的休息，锻炼，调节好心情，饮食来减少复发的可能。一定要尽量做到规律作息，保证睡眠，适当的体育锻炼，保持口腔清洁，饮食全面适度，多吃含维生素和微量元素的食物。
复发性口腔溃疡吃维生素b、c等进行治疗，可能好得快。
复发性口腔溃疡应以根除病源、强化体质、辨证论治。在临床上，应该采取综合疗法、局部疗法、中医疗法、生理学疗法和心理学疗法。吃维生素b、c可以增强身体的免疫力，促进胃粘膜的修复。如果疼痛明显，溃疡多，间隔时间较长，可以选择免疫调整的药物，比如左旋咪唑、转移因子、胸腺素等，还可以口服强的松。