乙脑疫苗比较安全，仅有少数小儿会出现不良反应。注射乙脑疫苗后可出现发热，还可出现头痛、头晕、乏力、寒战等全身症状，也可出现腹痛、腹泻、呕吐等胃肠道症状，一般在1天内可自然消退。注射乙肝疫苗后还可出现局部不良反应，如注射部位发红、肿胀、出现疼痛、皮温升高等，局部的不良反应一般持续数个小时。
宝宝注射乙脑疫苗以后，大部分会出现低烧，如果体温在38度左右，可以用温水擦浴的办法进行降温。如果体温较高超过38.5度以上，就需要考虑服药退烧，发烧期间还需要观察孩子是否有咽喉红肿，口干舌燥等。
在打了疫苗后，容易出现感冒的症状出现鼻塞，流鼻涕，发烧，如果是症状轻的，不用担心要及时治疗，如果症状严重，需要到医院做检查，看看是不是细菌感染，如果有炎症，需要服用消炎药物的。
孩子打完乙脑疫苗后发烧一般不会超过三天,乙脑疫苗作为外源性的致热源,可以引起机体发热,这种发热一般大部分孩子都是低热,很少有高热的,持续时间不超过三天,大部分孩子在一天左右。另外，乙脑疫苗接种后的不良反应还包括注射局部红肿、疼痛以及食欲不振、胃肠不适等消化道症状，一般持续3天左右就会自动消失。在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。
宝接种完疫苗之后出现发烧是很常见的情况，建议给孩子服用药物，多注意给孩子喝水，进行物理降温。疫苗本身就是一种灭活性病毒，宝宝接种之后出现发烧的情况属于正常，需要每间隔半小时给宝宝测量一下体温，体温太高的情况下去要去医院打退烧针，孩子接种完预防针之后，抵抗力比较差，要注意保暖。
第1个是发热，乙脑疫苗接种后发热的概率还是蛮高的，大概在10%左右，一般多是中低热，持续2-3天；第2个是过敏，可以引起皮疹、瘙痒等第。3个是引起胃肠道症状，可以引起纳差、腹痛、腹胀、呕吐、腹泻；第4个可以引起类感冒样症状，包括鼻塞、流鼻涕、咽痛等症状。除此之外，乙脑疫苗还有一些罕见的不良反应，包括白细胞的减少、淋巴结的肿大、过敏性紫癜等。
