乙肝疫苗是十分安全的疫苗，很少有出现不良反应，那么在不良反应当中比较常见的有发热出皮疹。这种不良反应往往是一过性，充分的休息好，大部分都会在48小时之内完全好转。有极少数的打了乙肝疫苗，可能会出现严重过敏的情况，需要进行规范的抗过敏治疗，以后也不能再接种乙肝疫苗。接种完乙肝疫苗之后，需要充分的休息，保持一个良好的睡眠。
注射乙肝疫苗后的不良反应有局部的红肿及硬结短暂的炎症反应，一般2-3天自行消退。发热低中度发热一般会自行消退，高热的话及时就医。部分患儿会出现头痛、头晕、全身无力、恶心，呕吐，腹痛、腹泻等症状。
每个宝宝敏感程度不一样，有的宝宝没什么反应，有的宝宝会不好好吃奶、情绪不好容易哭，睡觉不踏实，有的宝宝会出现拉肚子、低烧、呕吐等现象。如果宝宝发烧超过3天没好，或者发烧超过38度，或者身上起疹子，就一定要去医院就诊，对宝宝没什么影响的。发烧的话正常发烧护理就好。
如果药物治疗后出现不良反应，可能会出现皮肤瘙痒或发热。因此，在过去的几天里应该更加注意观察。观察需要48小时。如果出现不良反应，应尽快在医院对儿童进行检查和治疗。然而，大多数儿童没有不良反应。因此，有必要观察孩子的饮食和食欲是否正常。
一般在输血以后，患者出现的一些感染以及并发症是需要关注的，比如输血以后会有可能感染上一些传染疾病，包括输血以后出现的高发热情况，以及排异情况，以及对于血液过敏，免疫系统溶血症等，患者可以多注意休息，随时观察身体状况和变化。
骨髓抑制：表现为白细胞，中性粒细胞，严重的骨髓抑制可引起感染或出血，定期如每周复查血常规可以及时发现上述异常，并根据实际情况采取相应措施。恶心呕吐：一般人比较轻微，可用胃复安止吐;少数人可能很严重，不能正常饮食，处理不及时可造成严重脱水和离子紊乱：一般比较轻微，可口服思密达治疗;少数人可能很严重，应及时就诊。
