一般情况下，手上起跖疣可以在医生的指导下使用抗病毒的药物和提高免疫的药物进行治疗，具体内容如下：
手上起跖疣通常是感染HPV引起的，建议患者平时做好个人的卫生护理，可以在医生的指导下使用药物进行治疗，如阿昔洛韦片、更昔洛韦片、盐酸伐昔洛韦片等，这些药物可以有效杀灭身体中的HPV，有较好的治疗效果，还可以在医生的指导下使用药物进行治疗，如胸腺肽肠溶胶囊、匹多莫德颗粒等，这些药物可以提高人体的免疫力，从而可以改善手上起跖疣的情况。
脚底长跖疣可以选择使用一些冷冻或者是激光的方式去除掉，有必要可以选择使用外用的抗菌软膏进行涂抹，连续外用两个月，目的是为了防止这种疾病复发，同时有必要可以选择光动力等方式进行治疗。治疗疗效相对来说会不错的。
跖疣病毒感染，对于这个疾病的治疗目前的治疗方法有冷冻、激光和外用药物。冷冻需要连续多次，每两周一次。如果非常多，可以用水晶膏化学制剂来腐蚀局部皮肤，从而治疗。浅层X线放射治疗也有效，不要让跖疣破裂，破裂流出来的水碰到好的皮肤会传染的。
鸡眼长跖疣，发生于足底的寻常疣，俗称水瘊子是一种人乳头瘤病毒感染，可通过皮肤微小破损而传播，到当地正规皮肤科治疗，可以通过激光治疗，自己的鞋袜，洗具用品，专人专用。
跖疣的治疗可以通过局部手术来完成，而对于较小的状态可以使用局部激光或微波来去除疣。经过激光或冷冻或微波治疗后，局部皮肤会出现坏死和感染的可能性。要及时用碘伏进行局部消毒，防止感染。
