结石疼痛大部分见于输尿管结石。输尿管结石引起疼痛主要是因为结石堵塞输尿管后引起输尿管痉挛，输尿管痉挛可引起急性剧烈疼痛，一般为绞痛，多合并有恶心，呕吐等症状。肾结石及膀胱结石，一般不会引起痉挛，所以疼痛较少见，如果有疼痛一般是隐痛，不会剧烈疼痛。
肾结石疼痛主要常位于患者的脊肋角、腰部、上腹部，多数呈阵发性，亦可为持续性。钝痛主要表现腰部酸胀不适、隐痛等，活动或劳动可促使疼痛发作或加剧。此外，严重时患者面色惨白，出冷汗、脉细而速，以至血压降落呈休克状态。同时多半有恶心呕吐、腹胀便秘。绞痛发作时，尿量减少，缓解后可有多尿现象。
一般是不痛苦的，在取得过程中，肯定有一些不适，所以没有必要太担忧。按照医生的嘱托取出就行了。取后通常需要多饮水，短期内可能有一些等不适，部分人取完输尿管支架管后可能合并有发热或者腰痛。
如果是肾脏内比较小的结石，也可以出现轻微的腰困，腰酸等。如果肾结石比较大，就会出现腰部明显的憋胀不适，尿血等。如果肾结石掉入输尿管狭窄处，还可以出现腹部剧烈的绞痛，恶心，尿频等症状。
结石疼的时候可以肛门内给药，最常见的就是双氯灭痛栓50mg纳肛，一般3-5分钟就可以缓解疼痛。也可以肌肉注射止疼药物，比如强痛定、杜冷丁、654-2、黄体酮等，也可以静脉滴注间苯三酚、654-2。