一般来说，打乙脑疫苗后发烧39度的原因如下：
疫苗的副作用可能会导致患者出现打乙脑疫苗后发烧39度的情况。正常情况下，发烧症状的时间不会持续太久，基本会在3天内缓解。口服布洛芬混悬液，多喝温水以及温水擦拭身体的物理降温方式都可以有效改善症状。
日常生活中，患者应注意多休息，避免过度劳累，保持心态平和，不要有太大的精神压力，还要注意个人饮食，多吃新鲜的蔬菜和水果，保证营养均衡，有利于身体恢复。
孩子打了乙脑减毒活疫苗以后出现发热，是比较常见的减毒活疫苗接种后反应。家长不要过于惊慌，具体如何处理，要看孩子发热的程度，体温高到多少度，有没有合并其他的严重不良反应。如果孩子的体温超过38.5℃以上，同时有严重的恶心、呕吐，全身皮疹，甚至出现了血管源性水肿以及过敏性休克的情况，要尽快到当地医院的儿科进行抗过敏治疗。
国疫苗类的制剂都是生物制剂，所以注射后是会出现发烧、过敏等副作用的，宝宝的体温超过三十八度五口服药物控制体温，但如果持续时间长或口服退烧药物无法控制体温，再去检查。
乙脑的症状，主要包括潜伏期的症状、初期的症状、极期的症状以及恢复期的症状。潜伏期大约为2-3周，没有很典型的症状。在初期，大约3-5天，主要表现为发热、头疼、呕吐、呼吸道症状。
打完乙脑疫苗后发烧可以先进行物理降温，比如擦拭身体，用毛巾冷敷额头，多喝水饮食清淡等，先不要用药，三天再不好就到医院检查一下，宝宝是由于打疫苗后引起的发烧,也就是说是接种反应,是正常现象。
打麻风乙脑不一定都发烧的，对于一些免疫力正好处于地下的时候，或者打麻风乙脑疫苗正好处于感冒没有症状期间，会造成孩子发烧的症状，但是大部分的时候，大麻风乙脑是不会发烧的。
