一般对于厌氧菌感染的患者，如果是体表部位的厌氧菌感染，需要开放创口，如将创口切开引流，并且将脓液引出。另外，局部注意用双氧水擦拭消毒之后，再用生理盐水或者蒸馏水冲洗，再用碘伏消毒覆盖无菌辅料或者创可贴。
进行抗感染治疗，口腔厌氧菌感染的时候，容易有牙根炎，牙髓炎等疾病的，这些疾病可以有局部的疼痛和肿胀，口腔厌氧菌感染很难及时治疗的，平时的饮食上一定要注意，还要避免熬夜。
按照正确科学的方法刷牙，把牙缝中的食物残渣都刷掉。如果有感染，可以使用漱口水，但不能长期使用，免得破坏菌群平衡。脾胃弱消化不良更容易释放细菌，所以要通过合理饮食调理肠胃，还要经常运动，提高免疫力，以保持肠胃、口腔中的菌群平衡。
口腔厌氧菌不能根治，相较而言比较顽固，会反复的发作，口腔厌氧菌是指喜欢在无氧条件下生存的细菌，危害性非常大，如果口腔被这种细菌侵袭，那么就很容易导致一系列口腔疾病的发生。
厌氧菌在分解食物残渣时，会发出臭鸡蛋的难闻味道。解决厌氧菌口臭，要解决口腔卫生问题，按照正确科学的方法刷牙，把牙缝中的食物残渣都刷掉。如果有感染，可以口服药物，能够灭掉厌氧菌，也可以使用漱口水，但不能长期使用漱口水，免得破坏菌群平衡。
治疗口腔厌氧菌引起的口臭要吃些相关的药物。口腔问题，患有牙龈炎、牙周炎、口腔粘膜炎以及蛀牙，牙列不齐等口腔疾病的人，其口腔内容易滋生细菌而产生口腔异味，需要洗牙，补牙。
