治疗慢性附睾炎一般可以进行药物治疗、手术治疗。
1.药物治疗：慢性附睾炎主要是由于急性附睾炎没有完全根治，并且经常复发。慢性附睾炎的临床表现比较轻微，检查时会发现附睾部位有硬结，局部有压痛感，附睾不平滑，精索可能会变得更粗，此时可以口服敏感的抗生素，多喝一些水，这样可以有效的缓解病情。
2.手术治疗：但是，如果复发或者是抗感染的药物无效，可以选择手术摘除。
慢性附睾炎比较轻的症状，可以通过生活的调理，同时给局部的治疗，比如说抬高阴囊，局部的敷贴药物，还有理疗等来缓解症状，同时也需要积极的通过一些生活的调理，就是减少它的诱发的因素。
慢性附睾炎可以使用消炎药。香烟中的有害物质可以直接刺激呼吸道，烟雾会给周围人群的健康带来危害，所以，应杜绝烟草。忌寒凉食物：寒冷食物会刺激肠胃。局部热敷或理疗：以促进炎症消退。
慢性附睾炎的治疗时间通常都是比较长的，病人常感患侧阴囊隐痛、胀坠感，疼痛常牵扯到下腹部及同侧腹股沟，有时可合并有继发性的鞘膜积液。检查时附睾常有不同程度的增大变硬，有轻度压痛，同侧输精管可增粗，治疗时间通常需要一个月到数月不等。
慢性附睾炎应根据细菌培养及药敏试验选择药物。局部热敷或理疗，以促进炎症消退。对于反复发作的慢性附睾炎，可考虑附睾切除或输精管结扎，平时应该吃一些抗菌消炎的食物和吃清热解毒的食物，还有能增强免疫力的食物。
