耳廓畸形的病因尚不十分明确，未能发现特殊的确定致病因素，从环境和遗传方面的研究都表明有多种因素可能会导致畸形的发生。
除了遗传因素外，环境因素，包括生物、理化和心理因素也可能会导致耳廓畸形：
1、孕初期感染致病性病毒：包括感冒病毒、水痘带状疱疹病毒等。
2、母亲患免疫性疾病和糖尿病。
3、辐射及环境污染。
4、化学因素：怀孕早期使用激素类、磺胺类、部分中草药、抗病毒类药物、庆大霉素、链霉素、四环素、白霉素等抗生素。
5、孕期经常接触烟酒也是易感因素。
6、怀孕初期受到精神刺激也是诱发因素之一。
耳廓畸形需要手术治疗，为了不影响孩子的身心健康，手术应尽量争取在学龄前完成，婴儿耳廓畸形的种类有杯形耳、耳轮畸形、矫正治疗、治疗时间是两周左右，宝宝耳廓畸形好的治疗时间是出生后7-30天。
一般情况下，新生儿耳廓畸形可能是由于某些原因，阻碍胎儿的生长，从而造成身体的缺陷。具体分析如下：
第1鳃弓的生长率为15%，第二鳃弓为85%，胎儿1、2鳃弓的发育异常可导致外耳畸形，例如：小耳、招风耳、杯状、副耳等。当只有局部的软骨索条或突出的时候，往往伴随着外耳道的关闭和耳腔的异常，则必须进行外科治疗。耳朵外形不对劲，其它情况都是可以做的。
婴儿的耳朵出现有畸形，在孩子逐渐长大的时候，可以去正规医院美容科来进行校正。手术后，一般是要加强营养，多吃蛋白质含量比较高的食品来补充人体的蛋白质，促进伤口的恢复。
如果孩子还没有出生，并且已经检测到右耳畸形，引产。因为儿童已经检查了右耳郭畸形，并可能伴有中耳和内耳畸形。如果有中耳和内耳畸形，将来可能会发生先天性耳聋。如果是先天性耳聋，如果他不及时干预听力，可能会变得又聋又哑。怀孕时一定要注意坚持验孕。
