小儿在腹泻时多少都伴有肠道菌群的紊乱，可服用一些肠道微生态制剂，或肠黏膜保护剂。肠道微生态制剂和肠黏膜保护剂可以帮助缩短腹泻病程，效果良好。婴儿腹泻治疗方法具体还要看孩子的病情。病症重则需要去医院就医。
腹泻好多次，要先查明原因，患者可以到医院进行便常规，粪便细菌涂片及培养，再根据病因进行针对性治疗。
若为急性肠胃炎可给予诺氟沙星，黄连素和蒙脱石散。慢性之肠炎或结肠炎者，可给予肠炎宁和柳氮黄吡啶，溃疡性结肠炎者，则应给予美沙拉嗪或中药灌肠。腹泻较严重者，应给予甲氰咪胍，硫酸阿米卡星和氨基酸输液治疗。
腹泻不吃药能不能自愈，要看具体情况。如果腹泻比较轻微，平时要注意饮食和腹部保暖，腹泻通常会慢慢恢复。如果腹泻比较严重，出现脓血便、剧烈腹痛、发热、全身汗出等症状。这种伤势，根本无法愈合。腹泻患者需要在医生指导下口服左氧氟沙星片、蒙脱石散等药物进行治疗，同时注意日常护理，保持饮食健康，不吃辛辣刺激的食物，减少对胃肠的刺激。
饮食不当是造成婴儿腹泻的主要原因，预防腹泻首先要合理安排宝宝的饮食。牛奶的温度、浓度要合适。添加辅助食物应遵循从简单到复杂，从少到多，循序渐进的原则。每添加一种辅食，都要观察一段时间，再更换或增加另一-种食物，让宝宝的消化能力慢慢适应。喝太多果汁或含糖饮料也可能会使宝宝肚子不舒服，大便变稀。
如果宝宝仅腹泻，没有其他异常表现，可以口服蒙脱石散保护胃肠道粘膜及止泻，同时口服妈咪爱或者金双歧等益生菌调节胃肠道菌群失调及治疗腹泻。同时让宝宝适当的多饮水，避免宝宝脱水，并注意让宝宝尽量易消化饮食及加强腹部护理，避免腹部受凉，以免加重腹泻。如果宝宝有发热、脱水等异常表现，需要给予退热及补液等对症治疗。
