通常来说，慢性肠炎肚子疼吃枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊、阿托品、山莨菪素等药。
慢性肠炎肚子疼可能是由于长期的炎症所致的肠神经受到了刺激导致的，可以口服枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊等调节肠道菌群的药物，还可以配合阿托品、山莨菪素等解痉镇痛类的药物。平时也要避免食用过多的生冷和辛辣的食品，避免对肠胃造成刺激，导致病情恶化。
慢性肠炎是细菌，病毒，真菌或寄生虫引起的小肠和结肠的炎症。表现为腹痛，腹泻，稀水样便或粘液脓血便。小儿肠炎多因不洁东西所引起，故预防最要紧的是食物之清洁及保存安全。
能否获得治疗主要取决于引起肠炎的病因。细菌性肠炎通常发病于夏秋季节，进食不洁食物以后引起肠道菌群紊乱，通过及时的补液、以及抗生素治疗调整肠道菌群，通常可以获得治疗，而对于结核性的结肠炎，需要正规的抗结核治疗。
小儿慢性肠炎老反复，家长要注意护理。
慢性肠炎最明显的特征就是病程较长，而且很容易复发。生活中要让孩子保持良好的心态，不要受到精神刺激，缓解心理上的压力。同时要注意衣服的保暖，多运动，加强身体。饮食上要注意多吃一些柔软、易消化、营养丰富、热量充足的食物，同时要注意多吃维生素、少吃生冷、油腻的食物。慢性肠炎患者不能吃有气的食物，因为这种疾病会反复出现溃疡和疤痕纤维，从而使结肠的弹性下降，吃豆制品、炒蚕豆、白薯等易引起肠道内气体充盈，从而出现急性肠膨胀、溃疡穿孔等并发症。
慢性肠炎吃以下药效果比较好：
慢性肠炎是肠黏膜的慢性炎症。建议慢性肠炎的患者在医生的指导下服用蒙脱石散、固肠止泻丸、盐酸洛哌丁胺胶囊等药物进行治疗。此外，茯苓、白术、苍术、黄芪、五味子、陈皮、桔梗、赤小豆等中药也有助于改善症状，建议患者在医生的指导下合理服用。
建议慢性肠炎的患者平时要注意腹部保暖，还要注意多休息，早睡早起，有利于身体健康。
慢性或反复发作的腹痛、腹泻、消化不良等是儿童慢性胃炎的常见表现，临床表现为粘性或水样便。在护理上，要做到劳逸结合，不要过度疲劳，平时要注意保暖；可以通过适当的运动来提高身体素质。可以吃一些容易消化、营养丰富、卡路里充足的食品。不要吃生冷油腻多纤维食品。要选择一些帮助消化的药物，或者是保护胃黏膜的药物。
