运动神经元病的治疗，需要采取以下措施：
1、确定神经受损的位置和严重的程度，通过对神经的表现，可以确定受损的位置，这要求医师具备良好的解剖学和丰富的临床实践，才能做出相应的处理。
2、如何选用治疗方法。多数为局部的神经损害，例如牵拉伤、撕裂伤等。少数是全切的，例如被刀子割等。以神经吻合术为主，局部创伤以康复为主。
3、修复神经。神经的修复是一个很慢的过程，根据受损的程度和恢复的速度，一般需要一到两年的时间。
4、康复治疗。在康复训练中，对于运动神经元疾病，神经肌的电刺激疗法是一种很好的方法。
纯中药不能治疗运动神经元病运动，神经元病是神经科非常少见的一种疾病，因为它是一个非常缓慢变性的疾病，所以治疗起来比较困难。我们所使用的药物，唯一有证据的就是力如太，但这个药非常贵，一年大概国产的药可能都要七八万左右。有保护神经的药物，但总的来说这个药物可能只能延缓疾病的进展。
神经元疾病是很难完全治疗成功的。其发病严重时可侵犯脊髓前角细胞和脑干神经核以及大脑运动皮质锥体细胞导致呼吸困难吞咽障碍而危及生命，约有5%-7%和基因免疫异常或病毒感染所致。
运动神经元病的治疗方法包括病因治疗，对症治疗和支持治疗。对症治疗主要包括呼吸困难的病人，严重时可以上呼吸机，运动神元病是一组病因未明的选择性侵犯脊髓前角细胞，脑干后组运动神经元，皮质锥体细胞以及锥体束的慢性进行性神经变性疾病.。可以出现肌无力，肌萎缩，感觉和括约肌功能不受影响，严重时可以出现呼吸衰竭和吞咽困难。
运动神经元病没有特别有效的药物，而且病人的预后是不良的，治疗费用也是比较高的。当病人出现了急性期呼吸衰竭，还有就是进食困难、饮水呛咳的症状，治疗上主要就是要给予营养支持的治疗，比如给予病人呼吸机通气，还有就是因为进食困难要给予病人留置胃管，维持营养状态来进行治疗。
