婴儿室间隔缺损3.6毫米能否自愈，需要根据具体的情况来判断，具体分析如下：
根据身体的发育情况，可以在三个多星期后进行一次检查。超过mm的患者通常无法自行康复，建议进行外科手术。通常在2岁以后进行外科治疗。孕妇在孕期出现这种情况，一定要在孕期做好自己的防护措施，不要着凉导致的着凉，要保持足够的休息和休息。婴幼儿在日常生活中要保持清洁，要保持良好的生活习惯，防止感冒，也要保持良好的生活方式。
缺损的面积在三毫米以下有自然闭合的可能，发生与膜周部的室间隔缺损或者是肌部的室间隔缺损都有自然闭合的可能，多发生在出生以后一周岁以内，最迟不超过两周岁。这个期间尽可能避免受凉，避免发生呼吸道感染，避免呛奶，反复的呼吸道感染会使肺部的小动脉痉挛，使自然闭合的概率大大减少。
主要选择进行微创手术进行调理，如果长期的没有得到良好的治疗，就会导致出现有异常的兴奋心慌的症状，而且也会影响到心脏的其它方面的功能。在身体比较稳定下尽早进行手术，术后很快就会恢复正常的，是可以治好的。应放松心情，注意多休息，注意清淡营养膳食。
这个是属于先天性的心脏病，当然对孩子存在一定的不良影响的，如果一直没有自愈的话，那就需要通过心脏手术进行修补的，可以考虑手术治疗，但是手术比较大，风险比较大，费用也比较高，可以到大医院心脏外科手术治疗。
一般情况下，小孩小型室间隔缺损可能会对身体有出现心脏杂音、体循环不足、右心衰等影响，具体内容如下：
1.出现心脏杂音：如果小孩小型室间隔缺损的直径小于5毫米，通常对身体没有较大的影响，可能会在心脏听诊时出现心脏杂音。
2.体循环不足：如果小孩小型室间隔缺损直径超过5毫米，可能会导致小孩体循环不足，引起肺循环充血，使小孩容易出现乏力、气短等症状，容易发生呼吸道感染，生长发育也可能晚于同龄人。
3.右心衰：如果小孩小型室间隔缺损直径超过10毫米，可能会导致肺动脉高压，诱发右心衰。
儿童具有这种改变心脏检查结果的功能，而心脏检查的结果是8毫米或相对较大，自己可能不会长得很好，但是有些人会自己慢慢地修复5到8毫米，所以暂时去看医生而不要太注意。如果真的没有办法改善恢复，只能在两岁后进行手术。