接种后可能会在数个钟头后发热，乙肝疫苗可能会引起发热，这个时候身体对疫苗的敏感性是可以接受的，所以不需要吃药。
如果出现短期的高烧，不用着急，可以采取适当的物理降温措施，多饮水，多休息，两日后即可回复到正常的温度。高烧三日后仍未消失，需要到正规的医疗机构进行相关的诊断，明确病因，在医师的建议下进行处理。
乙脑疫苗包括乙脑减毒活疫苗和乙脑灭活疫苗两种，两种疫苗的接种时间是有区别的。首先是乙脑灭活疫苗是国家规定基础免疫共注射两针，出生后满6个月的婴儿，开始接种第一针，7到10天后接种第二针，一岁半到两岁左右，以及四岁的时候，各加强一针，六岁的时候再加强一针。其次是乙脑减毒活疫苗是1岁的时候接种第一针，2岁时加强免疫一针，7岁时再加强免疫一针。
乙脑疫苗的不良反应之中就会有发烧的症状，属于正常的免疫反应如果不超过39度，使用物理降温的方法。可以用温水擦拭身体，但注意保暖，也可以使用毛巾包裹冰袋儿，放于腋下，腹股沟处。
乙脑的症状，主要包括潜伏期的症状、初期的症状、极期的症状以及恢复期的症状。潜伏期大约为2-3周，没有很典型的症状。在初期，大约3-5天，主要表现为发热、头疼、呕吐、呼吸道症状。
乙型脑炎是由乙脑病毒引起的自然疫源性疾病，经蚊媒传播，流行于夏秋两季。无明显前驱症状，可有发热、食欲不振、轻度嗜睡、大儿童咳嗽药头痛，婴幼儿可出现腹泻。药物治疗为肾上腺皮质激素及其他治疗，对重症和早期确诊的即可应用，待体温静至38摄氏度以上持续两天即可逐渐减量，不宜超过七天。
打了乙脑疫苗后发烧属于很常见的不良反应，要根据孩子体温高低进行处理，体温小于38.5℃可物理降温，大于38.5℃需口服退烧药。一般这种原因造成的发烧症状会在24小时之后恢复正常。接种的疫苗是一种减毒或灭活疫苗，这种疫苗注射后，人体会产生一定的排斥反应，而发烧是人体的一种对抗病原微生物感染入侵的有益的保护性机制，这是人体在自我保护的行为，是属于正常的接种疫苗后的不良反应。
