巧克力囊肿破裂不是必须要切卵巢的。巧克力囊肿破裂，有时候需要急症手术来将巧克力囊液洗出，必要的时候进行患侧附件的切除或术后长期进行一些药物性闭经。对于有生育要求的女性，在手术以后，病人要尽早怀孕，对于无生育要求的围绝经期的女性，可以进行子宫加双侧附件的切除。
巧克力囊肿破裂要进行手术。巧克力囊肿破裂会引起剧烈的下腹部疼痛。应去医院急诊就诊，然后行腹腔镜微创手术，或者直接行开腹手术，将破裂的巧囊切除，而且还要将盆腔内的巧囊液完全清洗干净。因为巧克力囊肿是子宫内膜异位导致，如果不及时清理干净，就会导致内膜在腹腔各处异位生长。
卵巢巧克力囊肿破裂是临床上最常见的急腹症之一。如果囊肿体积相对较大，内出血量相对较大，还有贫血、休克等。联合起来，需要尽快进行外科治疗。任何时候都可能引起痛苦的休克等危及生命。因此，如果有这些症状，请尽快就医，随时准备住院，并执行袋液清洗和清除操作。
卵巢巧克力囊肿并不是都需要进行手术，到医院进行检查，通过医生的检查之后才能够给出正确的治疗方法，若囊肿直径小于5cm，没有明确症状可以不治疗，可以2-3个月进行一次复查。若随访中发现囊肿增长较快，手术剔除囊肿并做病理检查。
B超发现卵巢囊肿，明确告知囊肿是良性还是恶性，是否诊断卵巢巧克力囊肿，这是不现实的。b超可判定盆腔是否有囊肿，囊肿位置及囊肿内部结构，但不能诊断子宫内膜异位症。子宫内膜异位症有时很难与卵巢恶性肿瘤、结核病和炎性肿块区分开来。
