肉芽肿性前列腺炎最主要的症状就是排尿疼痛。排尿时尿道或伴耻骨上区、会阴部位疼痛。其疼痛程度有轻有重，常呈烧灼样，重者痛如刀割，有的病人还会出现排尿时伴有尿道烧灼感。
肺部有肉芽肿的患者，通常会有呼吸不顺畅的症状，从而会引发咳嗽，而且每次咳嗽的时候，胸部会疼痛，但是凭这些症状是很难断定是否有这病，应该要去做比较详尽的检查，有时候支气管炎也会有类似的症状，所以应该要去正规的医院进行诊断治疗。
常见的临床症状有寒战、发热、尿频、尿急、尿痛及排尿困难，甚至发生急性尿潴留。直肠指检可扪及前列腺有多发或单发硬性结节。前列腺大体标本表面可呈结节状，切面呈结节分叶状，部分腺体有小囊腔，或可见灰白色致密区域。
肉芽肿性前列腺炎有急性和慢性之分，急性发病突然，有寒战和高热，尿频尿急，尿痛，会阴部坠胀感，可发生排尿困难或急性尿潴留。慢性有排尿改变，尿不净，尿等待，有时分叉，性生活时有尿急感，排尿后和便后常有白色分泌物排出，俗称滴白，性功能减退，如阳痿，早泄等。
肉芽肿性前列腺炎初期症状，前列腺导管阻塞，原因包括细菌感染引发的炎症过程或外科创伤造成的组织坏死，前列腺增生也可能造成或加重前列腺导管的梗阻，有寒战、发热、尿频、尿急、尿痛及排尿困难，甚至发生急性尿潴留。直肠指检可扪及前列腺有多发或单发硬性结节。
表现为严重的下尿路感染症状，如发热、寒战、尿频、尿道烧灼感、尿痛，偶见血尿、会阴痛、耻骨上不适。肉芽肿性前列腺炎肿块一般发展较快，结节较大，有弹性，不规则，软硬不一致。
