两者最大的不同在于过敏性咳嗽只是咳嗽感受器敏感性增加，病变通常不累计气管支气管，咳嗽虽剧烈，但往往不会出现气紧的表现，气道反应性不高，肺功能通常是正常的。而咳嗽变异性哮喘则不同，咳嗽变异性哮喘本质仍然是哮喘，也可认为是轻度哮喘，病变累及气管、支气管，肺功能会有异常，气道反应性明显升高，在咳嗽时往往有气紧的情况。
咳嗽变异性哮喘吃抗过敏药不能治好，但是可以控制的。咳嗽变异型哮喘，可以服用抗过敏的药物进行治疗，多休息，不要进行剧烈活动，清淡饮食，不要吃辛辣刺激性食物，不要喝酒，也可以配合吸氧以及雾化治疗。
过敏性咳嗽是一种通俗的说法，在临床上是没有这个诊断的，咳嗽变异性哮喘是一个医学上的诊断，是慢性咳嗽中的一种，是支气管哮喘的一种特殊的形式。那么它形成的原因就是过敏原因导致的气道的高反应，以及气道的慢性炎症，从而出现的以咳嗽为主要表现的症状。所以说咳嗽变异性哮喘，也就是一种过敏性的咳嗽，两者都是过敏引起的。
过敏变异性哮喘的症状是咳嗽，在吸入刺激性气味，冷空气，剧烈运动后会干咳，另外在晨起或者夜间时也会出现干咳，持续性较长，除此之外，可能还会出现咽喉发痒等情况。
变异性哮喘患者如果哮喘控制得较好，身体状况感觉良好，是可以适当的进行锻炼，但应根据自己的能力进行锻炼，不可超出自己的身体耐受力，否则可能诱发哮喘。因跑步时体内失水比较多，当气道失水较多时，极易导致哮喘发作。患者平时应尽量避免接触过敏原，同时按照医生要求服用止咳平喘药物来控制哮喘，这样就可以进行适度的体育锻炼了。
嗜酸性粒细胞性支气管炎与咳嗽变异性哮喘的临床症状均是刺激性的咳嗽为主。通气功能多正常，但是咳嗽变异性哮喘表现为气道反应性升高，组胺和甲胆碱，支气管激发实验阳性或气道峰流速变异率大于20%，支气管舒张剂治疗可有效缓解咳嗽变异性哮喘的咳嗽症状。而嗜酸性粒细胞性支气管肺炎患者，多不存在气道的高反应性，通气功能正常，气道峰流速变异率正常。
