新生儿心肌炎的发病速度很快，而且很严重。预防新生儿心肌炎暴发流行，需要采取预防。
儿童出现流行性心肌炎时，应隔离两个星期，并对接触的人进行检疫。对易感者要给予血清免疫球蛋白，按体重0.2ml来计算，目前婴儿心肌炎的研究正在进行中，同时要注意防止产伤、窒息、寒冷、高热。
建议做好优生优育工作，减少新生儿死亡率，做好卫生期间的卫生保健，防止感染，加强婴儿室和母婴同房病房的管理，严格执行消毒和隔离。
卡介苗和乙肝疫苗可以一起打。
卡介苗是由减毒牛型结核杆菌悬浮液制成的活菌苗。卡介苗可与乙肝疫苗同时接种，不影响彼此效果，并能改善乙肝表面抗原阳性，但应分别向左，右两侧臂进行接种。接种24小时之内切忌沐浴，注意观察皮肤的表面状况及接种后的进食和排便情况、睡着了等，如果不舒服，要与接种机构取得联系，及时咨询医生。
饮食方面，重在母乳哺育，少量多次，如果有需要，可以进行鼻饲，在日常饮食中要多喂少量。平时要注意保持室内的安静，尽量减少不必要的刺激，要给孩子充足的睡眠，同时要做好防寒保暖，预防感冒，预防感冒，预防呼吸道和消化道感染。同时要遵守医嘱，在医生的指导下服药。
有不良反应一定要到医院进行检查。新生儿心脏疾患的类型多种多样，可以是突发性的，其特点是有节律的焦虑、气短、紫绀、面色惨白。这种情况会对宝宝的饮食造成影响，平时要注意多加注意，注意给宝宝喂奶。
新生儿心肌炎可根据患儿症状及辅助检查判断。新生儿心肌炎可表现为拒奶、呼吸困难、手脚冰冷、面色苍白、哭声微弱等症状，但不能通过单纯的症状诊断为心肌炎，还需要结合血常规、心肌酶等实验室检查。如果心肌酶升高，对心肌炎的早期诊断有一定意义。也可结合ECG早搏、房室传导阻滞和X线检查进行判断。如有必要，还可以进行心肌内膜活检，这是诊断心肌炎的金标准。
新生儿心肌炎需要住院输液治疗，平时多让孩子休息，营养心肌，改善循环，对症处理，一个到两个星期就可以恢复的。恢复了之后应该注意小孩的健康情况，避免受寒，心肌炎一般是由感冒病毒引起的。
新生儿在出生后要打的是卡介苗和乙型肝炎，在生后三日就要进行皮下注射。
如有皮肤的病变、发烧等早产儿，可以暂时停止使用卡介苗，因为有可能存在先天免疫障碍的婴儿不能打卡介苗，以免引起身体的全面感染。在出生24小时以内注射乙型肝炎，第二、三次注射分别为1-6个月。如果母亲是乙肝病毒携带者，那么孩子出生后6个小时内要注射100个单位的高质量的乙肝免疫球蛋白，还要打乙肝疫苗。