控制颅内高压、对症治疗及抗病毒治疗等方法进行治疗。另外干扰素、转移因子、免疫核糖核酸，核糖核酸酶均可酌情采用。患者生活中要积极的进行锻炼，以提高自身的抗病能力。
一般情况下，脑炎病人可使用下列药物输液：
1.抗病毒药物：静点特效药为无环鸟苷、碘苷、阿糖胞苷、丙种球蛋白注射剂等。
2.抗菌药物：根据细菌培养结果，选择敏感抗生素。如阿莫西林克拉维酸钾、头孢哌酮舒巴坦钠注射剂等。
3.对症治疗可：选择糖皮质激素静点或氢化可的松、地塞米松磷酸钠。
临床上脑炎患儿一般不宜静脉输注糖皮质激素和免疫抑制剂，但对病情较重或伴有感染时也应采用适当方法给予支持疗法。
对乙型脑炎的病人而言，通常是乙型脑炎病毒感染中枢神经系统，引起中枢神经系统发生炎症反应。由于病毒具有传染性，因此对人体造成严重的威胁。则不同感染部位和程度也不一样，患儿临床表现各异。例如有脑膜炎或者脑脓肿等症状。若发生某些脑炎，那就得把病人隔离起来，隔离须在独立的室内进行，并紧闭门窗，必须灭虫灭蚊。另外还有必要对病房内的环境进行消毒和通风等工作，这样才能够保证患儿不会受到病毒的影响。由于乙型脑炎多由该蚊虫叮咬传播，因此，必须用防蚊窗隔离，以免造成交叉感染。另外，还应该做好消毒工作，对病人进行彻底的消毒，这样才能够有效防止病毒传播出去。
此外，还需要抗病毒处理，针对不同病人，需对症治疗。
自救方法通常不可信，脑炎是一种非常严重的病，应该到医院就诊，并且采用正规治疗手法。当下最长见的治疗方法有对症治疗：服用糖皮质激素类药物，脱水利尿，降温；抗病毒治疗：干扰素类药剂肌注，疗程视病情而定，早期应用。
血清疗法：起病3天内患者可用恢复期患者或林区居住多年者的血清20-40ml肌注，或椎管内注射。药物治疗：抑制病毒在体内复制，防止病毒穿入细胞，使人体细胞产生抗病毒蛋白，疗程视病情而定，早期应用。
