直肠炎的治疗有灌肠，对于粪便硬块嵌顿导致的直肠炎应采取灌肠，解除粪便压迫。由于引发直肠炎的病因较复杂，治疗原则应根据引发直肠炎的病因及疾病采取相应的治疗措施。可以通过粪便、涂片或活检组织进行细菌、真菌和病毒检测；相关抗体及毒素测定。要注意休息和饮食。
直肠炎的治疗时间根据病症、严重程度、个人体质来说都是不同的，所以没有确定的能康复的时间。个人个体差异较大，生活方式不同，治疗方案不同，每个人对治疗的反应也不同，时间也不同。平时注意清淡饮食注意作息，会加快康复时间。
疱疹性直肠炎发病过后是很严重的，这种疾病发作过后会导致人们直肠出血，还会使得直肠排出很粘稠的液体，如果是单纯疱疹病毒感染导致的直肠炎，则很有可能导致病人的肛门剧烈疼痛，会使得便秘及腹泻现象交替出现，在病人的大便里面会看见很多粘液以及血丝，病人大便的时候肛门会有灼痛感，这主要是因为大便里面的分泌物对于肛门周围刺激导致的。
直肠炎治好是一件幸运的事，因为完全好的概率是不高的，当然防止复发很重要了。1、含酒精类的东西，刺激冰冻的不能吃，不吃太寒凉的东西，别吃辣椒等刺激性大的食物。2、重体力劳动不做，精神乐观，不要太劳累。别着凉，多运动，锻炼身体，保持心情愉快，作息时间有规律。
最主要的症状为腹泻，常常反复发作或持续不愈，轻者每天2～5次，重者20～30次，粪便性质个体差异极大，软便，稀糊状、水样、粘液便不一，但大便以粘液脓血便多见，有的表现为痢疾样脓血便。早上起床后腹泻及餐后腹泻最常见。个别病人还会出现便秘、腹泻交替进行的现象。
